158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6403 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  100 
 
 
884 aa  1768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  47.99 
 
 
727 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  46.37 
 
 
1147 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  46.94 
 
 
1077 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  50.17 
 
 
1131 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  45.92 
 
 
802 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  72.42 
 
 
753 aa  409  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  70.78 
 
 
788 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  84.44 
 
 
710 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  41.1 
 
 
947 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2479  peptidase M4 thermolysin  38.31 
 
 
508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  35.26 
 
 
527 aa  210  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  61.84 
 
 
504 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  41.87 
 
 
918 aa  197  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  45.63 
 
 
586 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  50.79 
 
 
663 aa  178  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  59.54 
 
 
592 aa  161  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.7 
 
 
1243 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  45.53 
 
 
691 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  29.53 
 
 
565 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6203  peptidase M4 thermolysin  29.55 
 
 
565 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231867  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1233  propeptide, peptidase M4 and M36  29.55 
 
 
565 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6599  propeptide, peptidase M4 and M36  29.55 
 
 
565 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1559  thermolysin metallopeptidase  29.96 
 
 
565 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.837695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0599  thermolysin metallopeptidase  29.96 
 
 
565 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0724  thermolysin metallopeptidase  29.96 
 
 
565 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2046  thermolysin metallopeptidase  29.96 
 
 
585 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2191  thermolysin metallopeptidase  29.96 
 
 
585 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.201777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2104  thermolysin metallopeptidase  29.96 
 
 
585 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  30.43 
 
 
532 aa  142  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  29.62 
 
 
565 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3836  propeptide, peptidase M4 and M36  28.9 
 
 
565 aa  137  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827362  normal  0.318438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4301  peptidase M4 thermolysin  28.37 
 
 
565 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  52.3 
 
 
672 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.08 
 
 
651 aa  117  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  60.83 
 
 
824 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  50 
 
 
1148 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  59.62 
 
 
601 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.67 
 
 
583 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  23.34 
 
 
1154 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  45.05 
 
 
622 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  51.96 
 
 
596 aa  99  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  58.56 
 
 
674 aa  97.8  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  54.86 
 
 
494 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  36.22 
 
 
641 aa  96.3  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  27.16 
 
 
546 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  25.97 
 
 
984 aa  94.7  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.04 
 
 
467 aa  94  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  63.16 
 
 
1016 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  60 
 
 
815 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  46.2 
 
 
726 aa  91.3  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  57.94 
 
 
597 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  46.84 
 
 
688 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  53.47 
 
 
840 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.88 
 
 
474 aa  89.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07560  thermolysin precursor  26.39 
 
 
1250 aa  85.5  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.6 
 
 
1072 aa  84.7  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  58.95 
 
 
580 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  32.39 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  34.48 
 
 
586 aa  81.3  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  26.69 
 
 
1251 aa  80.5  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.47 
 
 
933 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  27.67 
 
 
565 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  44.06 
 
 
778 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.06 
 
 
962 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  24.87 
 
 
791 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  44.44 
 
 
2079 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  43.03 
 
 
3244 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  28.42 
 
 
924 aa  74.3  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  25.66 
 
 
759 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.28 
 
 
724 aa  72.4  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  29.57 
 
 
566 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  29.57 
 
 
566 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  29.57 
 
 
566 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  34.96 
 
 
1779 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.84 
 
 
721 aa  71.2  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5185  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.42 
 
 
605 aa  70.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  30.81 
 
 
566 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.27 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  72 
 
 
518 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  24.87 
 
 
775 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  23.2 
 
 
1017 aa  68.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  30.81 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.27 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  30.81 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  30.81 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  30.27 
 
 
566 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  24.48 
 
 
701 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  33.18 
 
 
2402 aa  67  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  27 
 
 
498 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.73 
 
 
1321 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8540  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  26.47 
 
 
889 aa  64.7  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810503  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  47.73 
 
 
1338 aa  64.7  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  25.81 
 
 
485 aa  63.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  24.17 
 
 
778 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  24.17 
 
 
778 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  24.17 
 
 
778 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  24.17 
 
 
778 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0874  hypothetical protein  31.73 
 
 
674 aa  62.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903939  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  26.15 
 
 
499 aa  62.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>