145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4301 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1559  thermolysin metallopeptidase  86.02 
 
 
565 aa  983    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.837695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0599  thermolysin metallopeptidase  86.02 
 
 
565 aa  983    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  92.04 
 
 
565 aa  1068    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  86.02 
 
 
565 aa  972    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1233  propeptide, peptidase M4 and M36  93.1 
 
 
565 aa  1078    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3836  propeptide, peptidase M4 and M36  98.58 
 
 
565 aa  1131    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827362  normal  0.318438 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6599  propeptide, peptidase M4 and M36  93.1 
 
 
565 aa  1078    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2046  thermolysin metallopeptidase  86.02 
 
 
585 aa  984    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2191  thermolysin metallopeptidase  86.19 
 
 
585 aa  986    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.201777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2104  thermolysin metallopeptidase  86.02 
 
 
585 aa  984    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339655  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0724  thermolysin metallopeptidase  86.02 
 
 
565 aa  983    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28714  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6203  peptidase M4 thermolysin  92.92 
 
 
565 aa  1076    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231867  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4301  peptidase M4 thermolysin  100 
 
 
565 aa  1144    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  40.87 
 
 
527 aa  309  9e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  35.32 
 
 
532 aa  233  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  45.42 
 
 
221 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.72 
 
 
1131 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  31.62 
 
 
1154 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  27.78 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  29.68 
 
 
1077 aa  163  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2479  peptidase M4 thermolysin  30.83 
 
 
508 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  31.57 
 
 
546 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  28.65 
 
 
591 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  28.34 
 
 
591 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  27.87 
 
 
591 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  26.88 
 
 
556 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  28.76 
 
 
924 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  30.15 
 
 
565 aa  156  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  28.16 
 
 
554 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  29.86 
 
 
1147 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  28.16 
 
 
549 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  27.81 
 
 
554 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  30.48 
 
 
566 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  30.48 
 
 
566 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  30 
 
 
566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  27.11 
 
 
478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  31.45 
 
 
727 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  29.55 
 
 
566 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  27.86 
 
 
552 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  28.59 
 
 
566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  27.86 
 
 
547 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  30 
 
 
566 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  28.43 
 
 
566 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  28.43 
 
 
566 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  27.43 
 
 
984 aa  143  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  31.78 
 
 
947 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  28.71 
 
 
566 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  28.55 
 
 
884 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  28.99 
 
 
566 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  29.45 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  27.55 
 
 
556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  31.59 
 
 
509 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  31.59 
 
 
509 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  31 
 
 
507 aa  134  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  27.09 
 
 
556 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  29.01 
 
 
556 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  26.15 
 
 
891 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  25.43 
 
 
886 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  28.97 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  30.08 
 
 
802 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  31.69 
 
 
342 aa  114  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  25.53 
 
 
891 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  29.51 
 
 
1031 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  25.62 
 
 
890 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  32.85 
 
 
360 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  25.24 
 
 
884 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2742  metalloendopeptidase  24.48 
 
 
567 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00888041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  30.48 
 
 
341 aa  107  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  30.77 
 
 
351 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2787  metalloendopeptidase  25.14 
 
 
567 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000221035  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  30.38 
 
 
351 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  28.07 
 
 
357 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2415  thermolysin  24.04 
 
 
567 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000428909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2543  neutral protease  24.52 
 
 
567 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000016311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2499  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  29.36 
 
 
567 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000144667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2464  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  29.36 
 
 
567 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3392  bacillolysin  25.71 
 
 
565 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000112359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2730  neutral protease  24.52 
 
 
567 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2551  metalloendopeptidase  24.57 
 
 
567 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000846614  decreased coverage  0.0000000000277026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  29.11 
 
 
347 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2738  metalloendopeptidase  24.36 
 
 
567 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.89181e-27 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  28.97 
 
 
347 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3091  neutral protease (bacillolysin)  25.71 
 
 
565 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000299935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  23.25 
 
 
887 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  32.28 
 
 
350 aa  101  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3189  neutral protease  25.71 
 
 
565 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000741792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3442  neutral protease  25.71 
 
 
565 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  26.87 
 
 
498 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  31.49 
 
 
403 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  29.01 
 
 
498 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  24.11 
 
 
893 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0380  neutral protease  28.37 
 
 
568 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000306257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3408  bacillolysin  30.13 
 
 
565 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3170  neutral protease (bacillolysin)  30.13 
 
 
565 aa  99.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000070765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  29.75 
 
 
349 aa  99.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2762  neutral protease  28.07 
 
 
388 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  30.03 
 
 
1251 aa  98.6  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  28.07 
 
 
375 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  26.2 
 
 
609 aa  98.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  28.57 
 
 
353 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.912259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>