More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5253 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
273 aa  533  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4503  reductase  49.64 
 
 
267 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.54 
 
 
279 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0326  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.54 
 
 
279 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.54 
 
 
279 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.246664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.17 
 
 
281 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.312689  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.4 
 
 
288 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 
281 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 
290 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53721  normal  0.207776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2114  3 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase/carbonyl reductase  40.53 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1517  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
263 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
258 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
256 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4896  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0462854  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
259 aa  126  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1147  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
295 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  36.23 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
248 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1175  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.77 
 
 
241 aa  99.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267366  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
233 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2585  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
239 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2450  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.24 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0588797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3453  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
239 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  28.83 
 
 
272 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  28.83 
 
 
272 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
243 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
244 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
262 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5275  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
247 aa  92.4  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
257 aa  92.4  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
240 aa  92  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
268 aa  92  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3977  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0505376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
260 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01741  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  27.55 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0325  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.31 
 
 
243 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3542  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.71416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.04 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
224 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 
516 aa  89.4  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
238 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283409  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4885  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  33.83 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726379 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4796  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.2 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616684  normal  0.0456615 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
238 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.84 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
248 aa  89.4  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
243 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0711669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1067  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 
258 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3786  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.81 
 
 
274 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71727  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
261 aa  88.6  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3782  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.81 
 
 
274 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3855  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.81 
 
 
274 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
240 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.73 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318564  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198401  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.46 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0160173  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.848972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.591331  normal  0.119727 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.92 
 
 
239 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
262 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696289  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
258 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
265 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0113148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.55 
 
 
251 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000715788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
233 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.42 
 
 
245 aa  86.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.99 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 
252 aa  85.9  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
234 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.48 
 
 
256 aa  85.9  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
262 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>