More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3322 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3322  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  912    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.985105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1038  hypothetical protein  44.93 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3669  coenzyme F390 synthetase  38.05 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0627  coenzyme F390 synthetase  33.81 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.67 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  27.53 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  27.7 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.36 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  28.07 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  26.34 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  30.05 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  26.85 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  28.22 
 
 		 447 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  26.51 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  27.17 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  26.09 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.09 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  26.05 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  25.59 
 
 		 437 aa  94  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  27.79 
 
 		 436 aa  93.2  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  27.65 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  27.63 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  27.55 
 
 		 432 aa  91.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  26.3 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  27.09 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  27.32 
 
 		 432 aa  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  27.97 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  27.16 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.01 
 
 		 442 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  26.72 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  25.96 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  26.32 
 
 		 436 aa  86.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  27.03 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3613  coenzyme F390 synthetase  28.29 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0420369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  27.01 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  24.73 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  26.11 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  25.16 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  29.4 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  26.22 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  27.46 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  27.85 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  24.68 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  26.17 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  26.62 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  28.84 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  25.33 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  26.17 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  26.51 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  25.85 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  26.84 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  26.39 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  25.46 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  27.19 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  24.13 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  26.96 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  27.4 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  25.55 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  25.69 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  26.09 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  27.69 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  26.84 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  27.9 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  25.86 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  26.48 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  27.29 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  25.92 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  26.25 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  26.41 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  25.36 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  26.82 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  25.53 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  25.19 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  23.68 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  26.01 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  26.54 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  28.05 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  24.29 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.5 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  25.51 
 
 		 694 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2689  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.61 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0708257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  24.67 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  27.04 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  25.84 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  27.9 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  24.18 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  27.2 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  26.29 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  24.72 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  26.48 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  25.41 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  25.95 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1449  phenylacetate-CoA ligase  27.13 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  27.6 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  25.13 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  25.13 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  26.15 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  27.51 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.32 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>