More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1518 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  100 
 
 		 469 aa  925    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  47.6 
 
 		 298 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  45.6 
 
 		 291 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  47.58 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  45.82 
 
 		 290 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  49.09 
 
 		 289 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  45.95 
 
 		 291 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  47.2 
 
 		 279 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  48.86 
 
 		 269 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  47.8 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  51 
 
 		 267 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  50 
 
 		 251 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  47.2 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  45.83 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  44.24 
 
 		 304 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  44.22 
 
 		 209 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  47.03 
 
 		 268 aa  163  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  48.97 
 
 		 254 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  43.84 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  43.9 
 
 		 247 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  43.13 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  41.33 
 
 		 216 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  38.37 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  36.33 
 
 		 342 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  43.42 
 
 		 267 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  37.82 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  40.28 
 
 		 266 aa  147  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  44.05 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  41.36 
 
 		 262 aa  143  9e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  39.21 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  40.78 
 
 		 220 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  38.18 
 
 		 213 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  45.79 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  37.73 
 
 		 213 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  43.98 
 
 		 243 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  40.89 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  40.44 
 
 		 289 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  38.39 
 
 		 225 aa  134  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  38.74 
 
 		 285 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  40.99 
 
 		 288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  32.88 
 
 		 286 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  42.01 
 
 		 261 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  40.76 
 
 		 219 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  38.2 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  35.65 
 
 		 284 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  35.65 
 
 		 284 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  35.65 
 
 		 284 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  38.99 
 
 		 230 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  34.75 
 
 		 284 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  37.21 
 
 		 299 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  40.1 
 
 		 199 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  35.9 
 
 		 225 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  34.93 
 
 		 309 aa  110  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  39.51 
 
 		 215 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  33.98 
 
 		 288 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  35.68 
 
 		 192 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  39.8 
 
 		 171 aa  98.6  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  38.31 
 
 		 200 aa  97.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  30.53 
 
 		 189 aa  97.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  38.46 
 
 		 190 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  37.63 
 
 		 173 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  36.28 
 
 		 221 aa  95.1  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  34.62 
 
 		 220 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  36.41 
 
 		 197 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  34.45 
 
 		 186 aa  94.4  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  37.31 
 
 		 187 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  34.11 
 
 		 200 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  36.14 
 
 		 219 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  34.11 
 
 		 200 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  33.66 
 
 		 189 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  36.18 
 
 		 209 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  33.66 
 
 		 192 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  37.44 
 
 		 190 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  35.57 
 
 		 186 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  34.54 
 
 		 174 aa  91.3  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  34 
 
 		 250 aa  90.9  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  34.5 
 
 		 214 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  33.51 
 
 		 198 aa  90.1  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  34.54 
 
 		 192 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  38.12 
 
 		 197 aa  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  33.8 
 
 		 181 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  35.45 
 
 		 247 aa  89  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  37.19 
 
 		 199 aa  89  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  34.54 
 
 		 193 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  33.02 
 
 		 230 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  33.94 
 
 		 214 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  33.49 
 
 		 225 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  33.33 
 
 		 188 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  32.41 
 
 		 221 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  35.21 
 
 		 208 aa  87  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  34.83 
 
 		 216 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  30.56 
 
 		 225 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.27 
 
 		 184 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  32.55 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  32.67 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  31.65 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.65 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  33.94 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  33.49 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  29.95 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>