279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1027 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1027  peptidase S41  100 
 
 
509 aa  1028    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0560517  normal  0.0627841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  40.33 
 
 
452 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6647  peptidase S41  38.92 
 
 
488 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  36.09 
 
 
472 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  28.86 
 
 
482 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  24.78 
 
 
428 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  28.24 
 
 
483 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 
428 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  29.92 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  24.36 
 
 
377 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  25.3 
 
 
465 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  23.61 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 
377 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  23.99 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  23.68 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  23.82 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  24.12 
 
 
472 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  24.23 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  22.71 
 
 
547 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  23.12 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  24.56 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  26.39 
 
 
555 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  22.28 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  24.82 
 
 
383 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  24.23 
 
 
402 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  24.2 
 
 
401 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  23.84 
 
 
401 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  24.89 
 
 
572 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  22.92 
 
 
417 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 
446 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 
401 aa  64.3  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  24.78 
 
 
415 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
423 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2810  carboxy-terminal protease  27.63 
 
 
683 aa  63.5  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25.89 
 
 
457 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 
400 aa  63.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 
379 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  27.63 
 
 
557 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3806  peptidase S41  28.93 
 
 
509 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  29.54 
 
 
377 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  22.42 
 
 
401 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  22.36 
 
 
429 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  22.18 
 
 
478 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  22.18 
 
 
478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  24.63 
 
 
511 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  22.06 
 
 
401 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  25.45 
 
 
507 aa  60.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  28.95 
 
 
442 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  21.35 
 
 
428 aa  60.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  24.33 
 
 
513 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  26.02 
 
 
515 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  25.47 
 
 
1059 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  28.25 
 
 
680 aa  60.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 
515 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  22.44 
 
 
478 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 
515 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 
515 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  21.48 
 
 
469 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  23.19 
 
 
397 aa  60.1  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  25.18 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  24.81 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  25.51 
 
 
538 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  22.06 
 
 
401 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  25.23 
 
 
1081 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  22.56 
 
 
1016 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  23.72 
 
 
401 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  21.48 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  21.48 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  27.44 
 
 
395 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  21.48 
 
 
478 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  28.02 
 
 
550 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  24.22 
 
 
528 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  25.62 
 
 
565 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  21.48 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  21.48 
 
 
469 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0686  peptidase S41  27.5 
 
 
539 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407654  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  21.48 
 
 
469 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  22.82 
 
 
426 aa  58.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  21.71 
 
 
401 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  24.04 
 
 
521 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  25.24 
 
 
457 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  28.74 
 
 
1051 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0234  peptidase S41  27.14 
 
 
469 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.87 
 
 
1082 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0718  peptidase S41  27.14 
 
 
564 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  23.73 
 
 
444 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  23.82 
 
 
524 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1430  carboxyl-terminal protease  24.53 
 
 
504 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.729233 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  23.82 
 
 
530 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  23.82 
 
 
524 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  23.82 
 
 
524 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  23.82 
 
 
530 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  23.82 
 
 
524 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2828  peptidase S41  25.88 
 
 
434 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.282259 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  23.82 
 
 
524 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0277  peptidase S41  23.85 
 
 
447 aa  57.4  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  22.51 
 
 
436 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0038  C-terminal processing peptidase  29.68 
 
 
534 aa  57.4  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  24.88 
 
 
544 aa  57.4  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  22.51 
 
 
436 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>