More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0675 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  100 
 
 
285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.3 
 
 
302 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  56.63 
 
 
308 aa  321  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  56.16 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  54.42 
 
 
304 aa  308  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.71 
 
 
292 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  52.3 
 
 
299 aa  285  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  45 
 
 
301 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  40.64 
 
 
288 aa  221  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  43.06 
 
 
292 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  41.75 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  37.76 
 
 
288 aa  211  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  37.89 
 
 
290 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 
290 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 
290 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  44.88 
 
 
294 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.49 
 
 
322 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  37.32 
 
 
290 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
290 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  37.32 
 
 
283 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  36.71 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.35 
 
 
290 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  42.04 
 
 
238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
335 aa  188  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  37.93 
 
 
290 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  34.51 
 
 
297 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  38.19 
 
 
287 aa  175  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  34.74 
 
 
304 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  42.39 
 
 
295 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  29.44 
 
 
299 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  33.02 
 
 
299 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  33.99 
 
 
296 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 
277 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  34.23 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  30.36 
 
 
291 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  34.08 
 
 
295 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  28.11 
 
 
291 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  35.55 
 
 
298 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  35.1 
 
 
287 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  26.42 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  30.28 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02930  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.32 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  30.77 
 
 
291 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 
284 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  26.36 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  37.09 
 
 
305 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  30.32 
 
 
291 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  30.49 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  28.09 
 
 
280 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  27.23 
 
 
283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  27.23 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  33.33 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  31.02 
 
 
297 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  32.89 
 
 
293 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  28.11 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  32.14 
 
 
281 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  33.03 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  30.8 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  29.28 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  27.49 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  31.5 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 
285 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  30.88 
 
 
289 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  29.89 
 
 
287 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  29.68 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  24.91 
 
 
304 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  29.44 
 
 
232 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  28.51 
 
 
292 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  29.22 
 
 
236 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  30.36 
 
 
283 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
295 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  27.57 
 
 
233 aa  106  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  30.96 
 
 
302 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  25.96 
 
 
287 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  27.47 
 
 
293 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  29.12 
 
 
287 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  29.5 
 
 
287 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 
293 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  28.5 
 
 
293 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  31.94 
 
 
233 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 
293 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  33.64 
 
 
298 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  27.1 
 
 
293 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  28.5 
 
 
293 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  34.68 
 
 
320 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  30.2 
 
 
293 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  28.5 
 
 
293 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  28.04 
 
 
293 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  28.5 
 
 
293 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  23 
 
 
287 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.48 
 
 
318 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
229 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  24.89 
 
 
298 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  24.89 
 
 
298 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2222  ABC transporter related protein  31.4 
 
 
286 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0568841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  29.33 
 
 
280 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6370  ABC transporter related  32.89 
 
 
283 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>