More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6370 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6370  ABC transporter related  100 
 
 		 283 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  57.97 
 
 		 281 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  44.01 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  44.37 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  42.81 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3574  ABC transporter related  39.93 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034962  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  40.66 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  37.02 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  29.82 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  36.57 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  36.57 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  36.57 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  36.57 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  34.87 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  30.52 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  30.57 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  35.58 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  35.58 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  35.58 
 
 		 287 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  27.97 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  28.85 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  34.29 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  28.33 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  29.07 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  29.07 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  28.63 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  35.75 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 		 290 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  27.97 
 
 		 288 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  27.97 
 
 		 288 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  31.62 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  36.6 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.84 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  27.98 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  35.07 
 
 		 280 aa  125  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  29.07 
 
 		 290 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  28.84 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  28.63 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  30.09 
 
 		 230 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  27.31 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  30.69 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  31 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  29.59 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  31.88 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  32.13 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  32.13 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  29.96 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  31.19 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0504  ABC transporter related  32.41 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  35.61 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  29.58 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  29.11 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  25.76 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  25.76 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  35.27 
 
 		 332 aa  118  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  25.36 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  32.31 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  29.3 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  32.13 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  28.82 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  27.49 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  30.73 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  27.4 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  34.4 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  25.18 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  25.44 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  36.87 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  34.31 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  29.03 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  30.73 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  40 
 
 		 229 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  30.37 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  30.28 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  33.48 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  34.84 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>