66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0653 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  100 
 
 		 294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  54.14 
 
 		 316 aa  278  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  37.91 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  39.79 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  41.79 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  39.36 
 
 		 546 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  36.59 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  36.69 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  41.28 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  35.34 
 
 		 351 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  34.41 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  27.21 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  29.78 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  26.11 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  26.11 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  27.05 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  26.8 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  26.1 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  23.24 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  27.42 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  27.42 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  24.25 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  24.25 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  24.25 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  24.25 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  24.25 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  24.25 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  24.25 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  24.25 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  24.25 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  24.56 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  25.09 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  27.36 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  29.32 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  25.91 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  27.13 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  24 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  24 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  24 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  24 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  24 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  23.84 
 
 		 338 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  25.86 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  25.5 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  27.37 
 
 		 370 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  23.76 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  23.51 
 
 		 338 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  25.5 
 
 		 538 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  22.51 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  24.19 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23.7 
 
 		 525 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  23.69 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  27.44 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  24.22 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  24.42 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  30.25 
 
 		 401 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.7 
 
 		 525 aa  42.7  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.54 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  24.58 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  25.41 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  31.47 
 
 		 347 aa  42.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>