165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2953 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 186 aa  383  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  65.05 
 
 		 186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  62.9 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  62.9 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  59.57 
 
 		 188 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  59.04 
 
 		 212 aa  238  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  59.57 
 
 		 204 aa  238  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  59.57 
 
 		 204 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  58.06 
 
 		 186 aa  235  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  61.29 
 
 		 186 aa  234  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  31.91 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  31.91 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  31.02 
 
 		 180 aa  97.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  30.48 
 
 		 180 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  30.37 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  30.85 
 
 		 180 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  35.38 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  34.36 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  30.48 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.81 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.73 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.55 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  30.85 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  31.52 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  30.81 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  30.81 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.73 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  31.15 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  28.19 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0312  phage integrase  27.41 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  30.1 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  27.57 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  31.18 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  28.8 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  30.27 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  27.96 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  29.26 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  29.26 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  29.26 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  28.42 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  28.65 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  29.57 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  28.72 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  30.11 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  28.19 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  29.57 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  31.28 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  29.57 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  29.57 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  34.21 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  46.43 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  27.68 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  28.14 
 
 		 292 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  28.14 
 
 		 292 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  28.14 
 
 		 292 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  27.92 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  27.72 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  27.72 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  26.95 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  28.26 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  28.26 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  28.26 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  28.26 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  28.26 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  28.26 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  28.26 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  28.26 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  29.33 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  24.36 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04790  integrase  43.24 
 
 		 274 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  28.57 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  27.27 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  26.23 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  27.92 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  28.22 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  26.23 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12664  integrase  28.66 
 
 		 332 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000304658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  27.44 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  32.73 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2671  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2717  hypothetical protein  25.15 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1628  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  23.7 
 
 		 290 aa  49.3  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  23.7 
 
 		 290 aa  49.3  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>