56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0639 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0639  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.554233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0650  TPR domain-containing protein  98.5 
 
 		 266 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1030  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.023544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3209  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.22 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00149401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1946  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2234  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 718 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 722 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 927 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 589 aa  49.7  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  31.91 
 
 		 344 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 377 aa  48.9  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.23 
 
 		 810 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1049 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 740 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.27 
 
 		 725 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.97 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.56 
 
 		 571 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1676 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1121 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 2262 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 589 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 634 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.79 
 
 		 732 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.42 
 
 		 733 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 878 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 		 390 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 586 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 409 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.49 
 
 		 1979 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1421 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  29.25 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 3301 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 629 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 566 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 597 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2035  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 393 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.72 
 
 		 863 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 3145 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.46 
 
 		 557 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81748  mitochondrial outer membrane specialized import receptor  40 
 
 		 585 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 833 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 465 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  29.06 
 
 		 837 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.75 
 
 		 397 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.3 
 
 		 875 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  27.96 
 
 		 652 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 183 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1406 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  32.5 
 
 		 417 aa  42.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>