More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01670 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1528 aa  3136    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  38.01 
 
 
971 aa  369  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  36.16 
 
 
941 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  37.17 
 
 
1565 aa  361  7e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  35.32 
 
 
551 aa  328  5e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.01 
 
 
756 aa  233  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  31.91 
 
 
750 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  32.14 
 
 
836 aa  216  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  29.45 
 
 
851 aa  216  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  29.94 
 
 
749 aa  206  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  29.33 
 
 
769 aa  206  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  29.83 
 
 
833 aa  205  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  29.67 
 
 
820 aa  205  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  29.18 
 
 
938 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  29.22 
 
 
829 aa  201  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  31.27 
 
 
754 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  29.4 
 
 
749 aa  198  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  30.06 
 
 
749 aa  194  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  29.64 
 
 
751 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  30.64 
 
 
751 aa  190  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  30.26 
 
 
776 aa  188  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  30.35 
 
 
745 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.38 
 
 
502 aa  154  8.999999999999999e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  36.24 
 
 
763 aa  127  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  33.66 
 
 
808 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01266  Pre-mRNA-processing ATP-dependent RNA helicase prp5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDW4]  26.42 
 
 
1173 aa  65.9  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505248  normal  0.0523257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  31.61 
 
 
516 aa  64.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05125  ATP-dependent RNA helicase  26.38 
 
 
447 aa  64.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.22 
 
 
562 aa  63.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 
618 aa  64.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.88 
 
 
545 aa  64.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.22 
 
 
590 aa  63.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1661  putative ATP-dependent RNA helicase  30.52 
 
 
441 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  35.51 
 
 
421 aa  63.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10380  Dicer-like protein 2 [Includes Endoribonuclease dcl2(EC 3.1.26.-);ATP-dependent helicase dcl2(EC 3.6.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C5H7]  24.16 
 
 
1269 aa  62.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917081  normal  0.453481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.41 
 
 
452 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141763  normal  0.273496 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3036  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  27.27 
 
 
453 aa  62.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  31.17 
 
 
561 aa  62.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4039  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
453 aa  62.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.541201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001255  ATP-dependent RNA helicase  25.77 
 
 
443 aa  62.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.22 
 
 
913 aa  62.4  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4532  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.33 
 
 
440 aa  62.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
453 aa  62.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512002  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  39.73 
 
 
822 aa  61.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  56.86 
 
 
943 aa  61.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  45.76 
 
 
460 aa  61.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1240  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.01 
 
 
506 aa  61.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.502604  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.97 
 
 
405 aa  61.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.38 
 
 
516 aa  61.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 
561 aa  60.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1418  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  47.54 
 
 
401 aa  60.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.71 
 
 
562 aa  61.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.52 
 
 
579 aa  60.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  31.4 
 
 
572 aa  60.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.27 
 
 
545 aa  60.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94867  predicted protein  25.37 
 
 
575 aa  60.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0308188  normal  0.0300986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2006  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.53 
 
 
483 aa  61.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2742  ATP-dependent RNA helicase SrmB  30.7 
 
 
613 aa  61.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1354  type III restriction enzyme, res subunit  28.72 
 
 
660 aa  60.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0575606  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1437  DEAD/DEAH box helicase-like  34.07 
 
 
446 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.16 
 
 
731 aa  60.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  50.91 
 
 
954 aa  60.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.69 
 
 
527 aa  60.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
678 aa  60.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  33.33 
 
 
946 aa  60.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3579  DEAD/DEAH box helicase-like  25 
 
 
421 aa  59.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.4 
 
 
531 aa  59.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.75 
 
 
448 aa  59.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00759671  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1501  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.93 
 
 
456 aa  59.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  43.33 
 
 
396 aa  59.3  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0169  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.35 
 
 
561 aa  59.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000471101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3057  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.96 
 
 
577 aa  59.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186187 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1733  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.66 
 
 
712 aa  59.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38084  predicted protein  37.5 
 
 
440 aa  59.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.67 
 
 
653 aa  58.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.86 
 
 
629 aa  58.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.43 
 
 
464 aa  58.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.536242  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.67 
 
 
664 aa  59.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.67 
 
 
664 aa  59.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.23 
 
 
787 aa  59.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19290  putative ATP-dependent RNA helicase  32 
 
 
446 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.67 
 
 
664 aa  59.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34710  predicted protein  32.43 
 
 
723 aa  59.3  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.628608  normal  0.164519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.67 
 
 
597 aa  59.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  50.94 
 
 
939 aa  58.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.86 
 
 
629 aa  58.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  27.78 
 
 
590 aa  58.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0610  DEAD/DEAH box helicase-like  44.29 
 
 
432 aa  58.9  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.67 
 
 
655 aa  58.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 
634 aa  58.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.86 
 
 
629 aa  58.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.67 
 
 
624 aa  58.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.86 
 
 
629 aa  58.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  34.86 
 
 
629 aa  58.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.86 
 
 
629 aa  58.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0183  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.62 
 
 
560 aa  58.5  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.475928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.86 
 
 
629 aa  58.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  34.86 
 
 
629 aa  58.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  30.43 
 
 
589 aa  58.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.87 
 
 
574 aa  58.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>