More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG04420 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05885  alpha-1,3 glucan synthase (Eurofung)  43.14 
 
 		 2387 aa  1962    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.505869 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03307  alpha-1,3 glucan synthases (Eurofung)  43.34 
 
 		 2444 aa  2004    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506036  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04420  alpha-1,3-glucan synthase, putative  100 
 
 		 2430 aa  5038    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  27.47 
 
 		 650 aa  95.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 624 aa  93.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.05 
 
 		 549 aa  89.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.8 
 
 		 480 aa  87  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  24.95 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  24.02 
 
 		 925 aa  85.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  27.14 
 
 		 543 aa  84.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  25.8 
 
 		 1005 aa  84  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  27.14 
 
 		 543 aa  84.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.77 
 
 		 1942 aa  83.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  26.21 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.21 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  26.21 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  26.21 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  26.21 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  26.21 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  26.21 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  26.21 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  26.46 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  26.46 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  26.46 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  26.46 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  26.21 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  26.46 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.04 
 
 		 814 aa  82.4  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2277  glycogen synthase  24.57 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.100037  hitchhiker  0.00503982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  21.72 
 
 		 1017 aa  82  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  26.76 
 
 		 478 aa  82  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.44 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  24.66 
 
 		 655 aa  78.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  26.79 
 
 		 513 aa  77.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  24.25 
 
 		 653 aa  78.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  20.97 
 
 		 723 aa  78.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.33 
 
 		 483 aa  77.4  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.4 
 
 		 476 aa  77.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  25.58 
 
 		 482 aa  76.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25 
 
 		 1855 aa  76.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.71 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.72 
 
 		 836 aa  75.9  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  26.51 
 
 		 477 aa  75.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  22.78 
 
 		 609 aa  75.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  22.93 
 
 		 659 aa  75.5  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  25.36 
 
 		 509 aa  74.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  24.07 
 
 		 662 aa  75.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  27.63 
 
 		 533 aa  74.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  27.74 
 
 		 479 aa  73.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  26.22 
 
 		 477 aa  74.3  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.95 
 
 		 490 aa  74.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  27.44 
 
 		 482 aa  74.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  27.63 
 
 		 529 aa  74.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03376  glycogen synthase  29.11 
 
 		 509 aa  73.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  24.58 
 
 		 483 aa  74.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0242  glycogen synthase  27.55 
 
 		 541 aa  73.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000133222  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2800  glycogen synthase  26.49 
 
 		 457 aa  73.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  27.02 
 
 		 544 aa  73.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.89 
 
 		 486 aa  73.2  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.89 
 
 		 486 aa  73.2  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  25.42 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.13 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  22.67 
 
 		 646 aa  72  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.29 
 
 		 481 aa  72  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24910  glycogen synthase  23.58 
 
 		 497 aa  71.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  23.41 
 
 		 476 aa  71.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  25.85 
 
 		 528 aa  71.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.68 
 
 		 467 aa  71.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  23.66 
 
 		 676 aa  71.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.88 
 
 		 481 aa  70.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.97 
 
 		 1891 aa  70.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  23.12 
 
 		 480 aa  70.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  24.83 
 
 		 479 aa  70.5  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  24.86 
 
 		 619 aa  70.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  23.08 
 
 		 476 aa  70.1  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  28 
 
 		 510 aa  70.1  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  28.15 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  26.79 
 
 		 489 aa  70.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  21.74 
 
 		 838 aa  70.1  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.53 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  28 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  30.08 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  23.57 
 
 		 487 aa  68.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  23.97 
 
 		 519 aa  68.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  25.96 
 
 		 617 aa  68.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  23.57 
 
 		 487 aa  68.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  23.6 
 
 		 687 aa  68.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4050  glycogen synthase  23.75 
 
 		 519 aa  68.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  23.87 
 
 		 478 aa  67.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  29.71 
 
 		 610 aa  67.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  24.5 
 
 		 477 aa  68.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  25 
 
 		 688 aa  67.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  23.6 
 
 		 687 aa  67.4  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.36 
 
 		 1975 aa  67.4  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  23.28 
 
 		 480 aa  67.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49880  predicted protein  35.48 
 
 		 546 aa  67.4  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.869026  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  24.34 
 
 		 675 aa  66.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3649  glycogen synthase  23.75 
 
 		 519 aa  67  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0827399  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  24.06 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  31.71 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>