More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3293 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  100 
 
 
261 aa  535  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.76 
 
 
259 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  56.68 
 
 
260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3793  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.86 
 
 
272 aa  275  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1825  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.94 
 
 
266 aa  271  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.54 
 
 
269 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4168  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.51 
 
 
263 aa  244  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000324578  decreased coverage  0.0000000000679641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.23 
 
 
265 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.96 
 
 
265 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
269 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.21 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
264 aa  211  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.77 
 
 
267 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.47 
 
 
267 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.94 
 
 
266 aa  207  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.44 
 
 
270 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
273 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.69 
 
 
271 aa  205  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.94 
 
 
266 aa  205  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.26 
 
 
267 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
264 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.56 
 
 
266 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.7 
 
 
265 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 
263 aa  201  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.92 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 
279 aa  198  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.37 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.51 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
285 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.97 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 
265 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.69 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.41 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.68 
 
 
271 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
285 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
277 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.18 
 
 
262 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.54 
 
 
270 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
269 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
295 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.51 
 
 
267 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.02 
 
 
270 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
262 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.89 
 
 
266 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.37 
 
 
267 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 
266 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.64 
 
 
260 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
270 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.251699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.54 
 
 
277 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.54 
 
 
277 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.92 
 
 
265 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.37 
 
 
266 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.13 
 
 
278 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.37 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.13 
 
 
278 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.51 
 
 
268 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.6 
 
 
265 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 
266 aa  188  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
278 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
276 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  41 
 
 
267 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.86 
 
 
271 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
264 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
274 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
264 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.29 
 
 
268 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.7 
 
 
263 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.7 
 
 
263 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
263 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.29 
 
 
279 aa  185  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.44 
 
 
281 aa  185  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
277 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
271 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.76 
 
 
267 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0972  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.93 
 
 
295 aa  184  9e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0625628  hitchhiker  0.000581353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.4 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  40 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.86 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.44 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.1 
 
 
267 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.19 
 
 
261 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
263 aa  182  6e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.58 
 
 
261 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.46 
 
 
261 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.890478  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.98 
 
 
267 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
262 aa  182  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>