265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3171 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3171  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  53.75 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  46.5 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1941  50S ribosomal protein L10  45.57 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0392  50S ribosomal protein L10  43.04 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0847  ribosomal protein L10  44.87 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1708  ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0962108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1398  50S ribosomal protein L10  42.59 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0424  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000721465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00035  putative 50S ribosomal protein L10  40.13 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  38.18 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  34.94 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  38.78 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  34.46 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  37.86 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  36.3 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  33.78 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  33.79 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  31.08 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  31.54 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  31.91 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  34.75 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  31.17 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  34.04 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  32.1 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  32.1 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  33.56 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  31.03 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  30.87 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  30.56 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  34 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  30.3 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  31.94 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  31.43 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  31.43 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  32.48 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  30.56 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  30.56 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  30.56 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  30.99 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  31.08 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  30.49 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  32.28 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  30.52 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  30.25 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  28.03 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  29.86 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  29.93 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  29.86 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  31.17 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  31.17 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  30.56 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  28.03 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  28.12 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  27.21 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  29.93 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  30.3 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  28.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  28.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  28.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  27.63 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  27.63 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  29.17 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  28.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  28.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  29.8 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  29.86 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  28.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  31.58 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  28.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  27.88 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  28.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  28.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  28.47 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  25.95 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  27.81 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  31.29 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  25.93 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  28.21 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  27.71 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  32.17 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>