110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2353 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2353  transposase  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  52.05 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  46.76 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  40.58 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  39.04 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  34.31 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  34.29 
 
 		 152 aa  97.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  35.04 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  34.53 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  31.65 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  35.71 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  30.3 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  34.85 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  35.16 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  34.43 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  32.37 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  28.67 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  34.51 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  32.48 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  30.5 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  36.89 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  24.78 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  24.78 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  24.78 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  23.48 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  23.39 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  23.48 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  22.12 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  21.6 
 
 		 315 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  25.44 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  24.19 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1440  transposase  47.92 
 
 		 67 aa  48.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  22.76 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  24.19 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  21.6 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  22.95 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  22.95 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  30 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  30 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  30 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  25 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  22.5 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  24.78 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  25 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  23.02 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  22.13 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  23.02 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  26.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  26.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  26.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  26.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  26.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  26.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  26.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  26.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  26.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  25 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  25.6 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  35 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  27.05 
 
 		 187 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  27.05 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  27.43 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  27.2 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  25.42 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  25.66 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  23.68 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  19.83 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  25.83 
 
 		 142 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1464  hypothetical protein  32.53 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3154  transposase IS200-family protein  21.05 
 
 		 132 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  20.97 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  30.91 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  26.5 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  26.5 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  26.5 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  20.97 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  25.22 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  22.05 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  26.58 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  26.58 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  24.39 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  22.5 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  27.73 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  34.57 
 
 		 231 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  24.1 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  24.1 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  27.73 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  27.73 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  27.73 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  27.73 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  27.73 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  27.73 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>