19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1440 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1440  transposase  100 
 
 		 67 aa  135  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  82.09 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  48 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  50 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  46.55 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  43.1 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  44.83 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  46.43 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  44.83 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  48.89 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  40.98 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  47.92 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  41.07 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  41.38 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  57.14 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  36.76 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  40.82 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  56.25 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  40 
 
 		 134 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>