73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1441 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1441  transposase  100 
 
 		 149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1440  transposase  82.09 
 
 		 67 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  44.22 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  36 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  37.41 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  39.72 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  39.19 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  35.33 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  40.82 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  36.49 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  33.78 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  35.46 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  34 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  35.71 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  36.03 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  36.28 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  33.87 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  33.33 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  34.71 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  28.23 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  31.36 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  29.84 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  25.62 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  22.69 
 
 		 315 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  25.62 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  21.74 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  23.97 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  23.77 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  24 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  22.81 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  22.22 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  23.48 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  24.37 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  24.17 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  24.17 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  23.08 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  23.08 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  25.86 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  21.74 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  23.48 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  24.14 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  29.31 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  21.49 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  26.23 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  22.52 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  22.68 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  25.4 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  23.02 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  23.89 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  20.51 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  25.22 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  26.19 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  19.51 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  25.2 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  24.35 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  24.35 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  21.74 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  20.49 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  25.2 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  25.2 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  25.2 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  25.2 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  19.51 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  25.22 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  24.35 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  23.01 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  23.01 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  28.57 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  20 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  22.76 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  20.17 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  20.87 
 
 		 140 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  21.43 
 
 		 132 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>