More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2684 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  81.62 
 
 		 171 aa  240  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  81.62 
 
 		 140 aa  239  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  76.12 
 
 		 140 aa  204  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1214  transposase IS200-family protein  70.37 
 
 		 135 aa  191  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5851  transposase IS200-family protein  69.17 
 
 		 134 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.626877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  51.61 
 
 		 133 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  56.67 
 
 		 133 aa  148  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5919  transposase IS200-family protein  62.22 
 
 		 131 aa  144  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  57.02 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  57.5 
 
 		 133 aa  141  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  57.63 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  57.63 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  50.4 
 
 		 136 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  56.91 
 
 		 136 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  50 
 
 		 132 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  50 
 
 		 132 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  50.82 
 
 		 140 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  52.54 
 
 		 136 aa  132  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3849  transposase IS200-family protein  56.3 
 
 		 152 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 131 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 131 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  50.41 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  49.14 
 
 		 131 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  48.84 
 
 		 128 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  48.41 
 
 		 132 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  49.57 
 
 		 129 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  47.9 
 
 		 133 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  45.31 
 
 		 128 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  48.7 
 
 		 129 aa  121  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  47.83 
 
 		 129 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  47.83 
 
 		 129 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  47.83 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  49.57 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  45.31 
 
 		 136 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  47.86 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  48.33 
 
 		 130 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  44.83 
 
 		 121 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  44.83 
 
 		 132 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  44.83 
 
 		 132 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  43.41 
 
 		 133 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  47.27 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  47.27 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  41.67 
 
 		 133 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3188  transposase IS200-family protein  44.63 
 
 		 132 aa  107  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  45.38 
 
 		 132 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 		 136 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  42.86 
 
 		 143 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2182  transposase IS200-family protein  44.63 
 
 		 132 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.872026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  42.48 
 
 		 117 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0156  transposase IS200-family protein  42.98 
 
 		 132 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207506  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3154  transposase IS200-family protein  44.92 
 
 		 132 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1754  transposase IS200-family protein  44.92 
 
 		 132 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.24327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  40.16 
 
 		 134 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1764  transposase IS200-family protein  44.07 
 
 		 132 aa  101  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0738  transposase IS200-family protein  43.8 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  41.03 
 
 		 126 aa  97.1  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  41.03 
 
 		 126 aa  97.1  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  41.03 
 
 		 126 aa  97.1  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4667  transposase  47.83 
 
 		 92 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0844  transposase IS200-family protein  42.37 
 
 		 132 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  39.06 
 
 		 129 aa  94.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  39.06 
 
 		 129 aa  94.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  34.68 
 
 		 133 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  34.68 
 
 		 133 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  34.68 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  34.68 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  39.06 
 
 		 127 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  35.29 
 
 		 149 aa  89.4  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  36.89 
 
 		 142 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  33.33 
 
 		 123 aa  87.8  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1198  transposase IS200-family protein  46.15 
 
 		 104 aa  87  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  hitchhiker  0.00571107 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  36.22 
 
 		 137 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  32.5 
 
 		 123 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  36.22 
 
 		 137 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  36.22 
 
 		 138 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  39.83 
 
 		 145 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  39.83 
 
 		 145 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  39.83 
 
 		 145 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  39.83 
 
 		 145 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  39.83 
 
 		 145 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  36.22 
 
 		 137 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  39.83 
 
 		 145 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  35.43 
 
 		 137 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  35.43 
 
 		 137 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  35.43 
 
 		 137 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  34.65 
 
 		 137 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2871  transposase IS200-family protein  33.58 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  35.54 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  32.8 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  38.98 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  38.98 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  34.13 
 
 		 146 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  38.98 
 
 		 145 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  38.98 
 
 		 145 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  30.58 
 
 		 148 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  35.9 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  38.4 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  38.98 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>