More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4597 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  100 
 
 
141 aa  293  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  48.59 
 
 
143 aa  146  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  45.52 
 
 
142 aa  130  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  37.9 
 
 
138 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  40.6 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  38.85 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  38.85 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  44.36 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  39.2 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  40.6 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  40.6 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  38.35 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  38.35 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  38.35 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  38.35 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  38.35 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  38.35 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  39.01 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  38.1 
 
 
136 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  38.4 
 
 
133 aa  93.2  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  37.98 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  38.76 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2723  transposase IS200-family protein  48.86 
 
 
94 aa  91.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  37.59 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  36.72 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  36.72 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  33.1 
 
 
143 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  40.52 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  36.75 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  40.48 
 
 
136 aa  87.8  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  38.4 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  38.1 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  35.04 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  34.35 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  34.59 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  33.33 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  33.33 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  33.33 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  33.33 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  33.33 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  33.33 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  37.01 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  35.04 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  34.59 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  35.38 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  30.71 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  33.33 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  37.98 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  34.96 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  36.15 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  38.46 
 
 
152 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  37.21 
 
 
160 aa  84  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  38.1 
 
 
152 aa  84  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  38.64 
 
 
155 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  34.19 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  40.52 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  37.69 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  35.38 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  34.19 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  38.1 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  34.4 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  37.98 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  36.92 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  36.92 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  32.06 
 
 
187 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  34.38 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  36.92 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  32.33 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  36.92 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  38.64 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  34.92 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  34.92 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  34.92 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  34.92 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  34.92 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  34.92 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>