More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0387 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  100 
 
 
136 aa  285  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  55.81 
 
 
133 aa  154  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  52.31 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  51.11 
 
 
136 aa  146  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  58.91 
 
 
133 aa  143  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  47.76 
 
 
136 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  56.91 
 
 
193 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  51.2 
 
 
132 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  51.2 
 
 
132 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  53.08 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  53.08 
 
 
140 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  49.6 
 
 
128 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  47.24 
 
 
132 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  47.24 
 
 
132 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  47.33 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  48.03 
 
 
132 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  48 
 
 
130 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  46.4 
 
 
136 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  45.6 
 
 
128 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5851  transposase IS200-family protein  48.8 
 
 
134 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.626877 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  51.3 
 
 
129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  48.44 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  48.44 
 
 
138 aa  118  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  48.44 
 
 
138 aa  118  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1214  transposase IS200-family protein  48.36 
 
 
135 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  50.43 
 
 
129 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  48.36 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  50.43 
 
 
129 aa  117  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  50.43 
 
 
129 aa  117  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  50.43 
 
 
129 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3188  transposase IS200-family protein  46.09 
 
 
132 aa  116  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  48.36 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  44.53 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  46.51 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  44.35 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  44.35 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0156  transposase IS200-family protein  46.4 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207506  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  45.38 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2182  transposase IS200-family protein  45.31 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.872026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  45.05 
 
 
117 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1764  transposase IS200-family protein  45.6 
 
 
132 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  42.97 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  40.91 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3154  transposase IS200-family protein  47.83 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0738  transposase IS200-family protein  44 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1754  transposase IS200-family protein  45.6 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.24327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  43.75 
 
 
134 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0844  transposase IS200-family protein  43.75 
 
 
132 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  45.54 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  47.32 
 
 
133 aa  106  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  42.24 
 
 
121 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  44.44 
 
 
129 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  44.44 
 
 
129 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  41.32 
 
 
133 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  36.84 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  38.52 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  42.15 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  33.83 
 
 
187 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  33.08 
 
 
187 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  33.08 
 
 
133 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  33.08 
 
 
133 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1198  transposase IS200-family protein  46.53 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  hitchhiker  0.00571107 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  37.4 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  33.33 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  36.59 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  33.85 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5919  transposase IS200-family protein  42.11 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  36.22 
 
 
142 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  32.52 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4667  transposase  43.48 
 
 
92 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  34.96 
 
 
138 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  33.08 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  32.5 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3849  transposase IS200-family protein  41.44 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416532  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  35.48 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  36.36 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  30.77 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  32.54 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  37.86 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  30 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  28.79 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  30 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  34.07 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  34.07 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  34.07 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  28.79 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  28.79 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  28.79 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  30 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  28.79 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  28.79 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  28.79 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  28.79 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  28.79 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  34.71 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  32.84 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  34.71 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>