More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1279 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  100 
 
 		 138 aa  290  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  75.91 
 
 		 146 aa  232  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  75.91 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  63.77 
 
 		 315 aa  189  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  63.04 
 
 		 175 aa  188  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  57.78 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  54.35 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  51.47 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  52.55 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  57.5 
 
 		 166 aa  148  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  52.55 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  51.13 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  50.36 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  50.39 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  47.66 
 
 		 133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  48.82 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  44.09 
 
 		 138 aa  120  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  40.77 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  40.77 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  40.77 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  40.77 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  40.77 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  40 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  40.77 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  40.77 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  43.08 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  37.4 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  37.4 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  37.4 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  36.8 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  36.64 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  36 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  36.8 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  40.17 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  37.31 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  36.43 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  36.43 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  36.09 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  38.17 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2203  transposase IS200-family protein  32.06 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  34.96 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  34.62 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0456  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3851  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0764343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0416  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.179707  normal  0.0295664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3555  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  33.85 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  34.85 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1192  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.541746  normal  0.0271846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  34.62 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  35.66 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  35.66 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  35.66 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  34.11 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  32.56 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  33.83 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  33.85 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  32.06 
 
 		 187 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  36.43 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  36.43 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  34.68 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  35.11 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  32.31 
 
 		 187 aa  88.6  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  37.04 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  35.11 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  35.11 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  32.31 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  32.31 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  35.11 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  31.01 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  32.31 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  36.03 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  35.11 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  31.71 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  31.71 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0226  transposase IS200-family protein  34.82 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.262027  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1624  transposase IS200-family protein  34.82 
 
 		 114 aa  84.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0519  transposase IS200  35.71 
 
 		 116 aa  84.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  35.66 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  30.4 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  34.96 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1061  transposase IS200-family protein  34.82 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  37.9 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  39.09 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  34.4 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>