More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2126 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  100 
 
 
139 aa  288  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  100 
 
 
139 aa  288  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  100 
 
 
139 aa  288  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
144 aa  187  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
144 aa  187  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
144 aa  187  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
144 aa  187  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
144 aa  187  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
144 aa  187  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
144 aa  187  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
144 aa  187  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  57.66 
 
 
144 aa  186  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  54.68 
 
 
148 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  54.68 
 
 
148 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  54.68 
 
 
148 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  54.68 
 
 
148 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  54.68 
 
 
148 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  54.68 
 
 
148 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  54.68 
 
 
148 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  53.96 
 
 
148 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  54.14 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  54.14 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  54.14 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  54.14 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  54.14 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  53.38 
 
 
145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  52.59 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  52.59 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  53.38 
 
 
145 aa  161  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  52.24 
 
 
145 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  52.24 
 
 
145 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  52.24 
 
 
145 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
145 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  43.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  42.86 
 
 
152 aa  120  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  44.27 
 
 
155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  44.27 
 
 
154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  43.51 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  43.51 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  43.51 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  43.51 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  43.51 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  43.51 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  43.51 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  42.86 
 
 
151 aa  115  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  39.23 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  39.55 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  38.81 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  40.48 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  44.09 
 
 
130 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  38.76 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  37.59 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  38.52 
 
 
143 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  36.09 
 
 
140 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3832  transposase IS200-family protein  39.23 
 
 
200 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  39.37 
 
 
136 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  40 
 
 
133 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
142 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0382  IS1469, transposase  35.38 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  38.13 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  34.81 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  34.81 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  34.81 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  34.81 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  34.81 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  34.81 
 
 
152 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2385  IS1541 transposase  35.11 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.935241  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0549  IS1541 transposase  35.11 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2286  IS1541 transposase  35.11 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  36.92 
 
 
137 aa  94  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  35.11 
 
 
148 aa  94  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3124  insertion sequence transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000108202  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3359  IS1541 transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.766936 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3905  IS1541, transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000085189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0029  IS1541 transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3065  IS1541 transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  34.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>