More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4507 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  100 
 
 		 140 aa  291  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  68.07 
 
 		 130 aa  191  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  64.39 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  48.46 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  47.69 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  48.44 
 
 		 154 aa  143  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  48.03 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  48.03 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  48.03 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  43.97 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  48.03 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  48.03 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  48.03 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  48.03 
 
 		 151 aa  143  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  48.44 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  46.76 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  43.97 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  47.69 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  44.68 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  44.68 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  44.68 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  44.68 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1946  transposase IS200  59.81 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  48.03 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  41.73 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  43.26 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0846  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2533  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3506  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2995  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3488  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1679  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1554  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2878  insertion sequence transposase  43.97 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0617  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000906641  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1297  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0116  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0333  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000846816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0407  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000708618  hitchhiker  0.0000208321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2889  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0029  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2812  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.67972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2613  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3031  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000139818  normal  0.117471 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0793  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365288  normal  0.44998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2631  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000741775  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3905  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000085189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3124  insertion sequence transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000108202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0279  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000713801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1138  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.130419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3173  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.616713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3065  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1972  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1827  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1993  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2930  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0848  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2576  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2234  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.893496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2455  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3388  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601978  normal  0.413736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2539  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3359  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.766936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3209  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000115009  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3020  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2283  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2227  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835855  hitchhiker  0.00464434 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0285  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3398  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3869  IS1541, transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000363831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2949  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.467669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1279  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000981056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0809  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0340  IS1541 transposase  43.97 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>