More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1432 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  100 
 
 
158 aa  331  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  98.73 
 
 
158 aa  328  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  82.58 
 
 
156 aa  275  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  78.21 
 
 
160 aa  267  5e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  76.92 
 
 
160 aa  265  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3832  transposase IS200-family protein  83.23 
 
 
200 aa  260  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  76.13 
 
 
156 aa  258  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0382  IS1469, transposase  71.92 
 
 
151 aa  228  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  65.77 
 
 
155 aa  221  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  65.33 
 
 
154 aa  222  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  67.59 
 
 
154 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  67.59 
 
 
154 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  67.59 
 
 
154 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  67.59 
 
 
151 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  65.79 
 
 
152 aa  216  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  67.59 
 
 
154 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  67.59 
 
 
154 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  67.59 
 
 
154 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  67.36 
 
 
151 aa  214  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0617  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  214  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000906641  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1554  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  214  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  63.82 
 
 
152 aa  214  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0104  IS605 family transposase  64.47 
 
 
152 aa  214  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.78108e-62  hitchhiker  1.21506e-131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0333  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  214  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000846816  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0057  IS605 family transposase  64.47 
 
 
152 aa  214  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.12196e-96  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  63.82 
 
 
152 aa  214  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2227  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  214  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835855  hitchhiker  0.00464434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1972  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  214  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  63.82 
 
 
152 aa  214  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  63.82 
 
 
152 aa  214  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3388  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  214  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601978  normal  0.413736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1138  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.130419  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0793  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365288  normal  0.44998 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3031  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000139818  normal  0.117471 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0116  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2812  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.67972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0407  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000708618  hitchhiker  0.0000208321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3905  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000085189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2613  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3020  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2283  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1827  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0029  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2539  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2576  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2455  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1993  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1297  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3065  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2930  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3124  insertion sequence transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000108202  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3359  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.766936 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1487  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.242166  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1439  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.413019  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0668  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00213867  normal  0.30365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0103  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0253  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000556152  hitchhiker  0.00000156199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3127  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.53689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2618  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.361666  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3616  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0285  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2751  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000125524  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0847  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.870119  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1609  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0741274  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1620  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.61818 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1602  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1836  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3626  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2877  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3398  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1020  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1967  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2598  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2168  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.0653376 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3050  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129671  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0340  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119674  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3134  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2935  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.964844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3159  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.963476  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3168  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3198  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225363  hitchhiker  0.00159351 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3353  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2332  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000426065  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2949  IS1541 transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.467669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1768  IS1541, transposase  64.47 
 
 
169 aa  213  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000130923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>