More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1800 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  100 
 
 
143 aa  300  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  64.39 
 
 
140 aa  190  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  62.81 
 
 
130 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  50.74 
 
 
154 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  50.74 
 
 
155 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1946  transposase IS200  63.55 
 
 
107 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  50.75 
 
 
152 aa  146  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  49.26 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  49.26 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  49.26 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  49.26 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  49.26 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  48.55 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  49.26 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  49.26 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  50.75 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  45.07 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  45.07 
 
 
158 aa  144  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  42.45 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  41.73 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  46.48 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  46.48 
 
 
145 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  46.48 
 
 
145 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  41.01 
 
 
156 aa  130  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1464  hypothetical protein  61.86 
 
 
125 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  45.77 
 
 
145 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0382  IS1469, transposase  42.45 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  45.77 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  45.77 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  40.29 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  42.55 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  41.84 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3506  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2533  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0846  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1679  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3488  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2995  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0057  IS605 family transposase  41.13 
 
 
152 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.12196e-96  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1554  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0617  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000906641  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1972  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0333  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000846816  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0104  IS605 family transposase  41.13 
 
 
152 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.78108e-62  hitchhiker  1.21506e-131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2227  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835855  hitchhiker  0.00464434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3388  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601978  normal  0.413736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2878  insertion sequence transposase  41.13 
 
 
178 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1439  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.413019  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1357  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0501528  decreased coverage  0.000176837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0809  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0793  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365288  normal  0.44998 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0116  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3127  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.53689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0029  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0103  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2469  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.627217  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0847  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.870119  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0407  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000708618  hitchhiker  0.0000208321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0253  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000556152  hitchhiker  0.00000156199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3869  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000363831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1836  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2613  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1978  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0027043  normal  0.681047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1993  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1992  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2168  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.0653376 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1297  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1020  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2584  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000573294  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2528  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1827  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1279  IS1541 transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000981056  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1768  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000130923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1967  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2877  IS1541, transposase  41.13 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>