More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2843 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  100 
 
 		 145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  99.31 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  98.62 
 
 		 145 aa  297  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  98.62 
 
 		 145 aa  296  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  96.53 
 
 		 145 aa  290  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  96.53 
 
 		 145 aa  290  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  89.39 
 
 		 145 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  89.39 
 
 		 145 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  89.39 
 
 		 145 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  89.39 
 
 		 145 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  89.39 
 
 		 145 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  88.64 
 
 		 145 aa  248  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  88.64 
 
 		 145 aa  248  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  69.39 
 
 		 148 aa  215  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  69.39 
 
 		 148 aa  215  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  69.39 
 
 		 148 aa  215  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  69.39 
 
 		 148 aa  215  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  69.39 
 
 		 148 aa  215  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  69.39 
 
 		 148 aa  215  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  69.39 
 
 		 148 aa  215  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  68.71 
 
 		 148 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 		 144 aa  204  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  62.5 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  52.24 
 
 		 139 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  52.24 
 
 		 139 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  52.24 
 
 		 139 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1951  IS200 family transposase  92.59 
 
 		 82 aa  158  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  47.73 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  47.73 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  43.66 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  42.96 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  45.77 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  44.93 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  44.7 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  44.7 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  44.7 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  44.7 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  44.7 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  44.7 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  44.7 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  44.2 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3832  transposase IS200-family protein  44.68 
 
 		 200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  43.28 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  39.29 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  41.43 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  41.55 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  41.55 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  41.55 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  41.55 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  37.59 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  41.55 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  42.11 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  36.88 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  41.41 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1297  IS1541 transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2995  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0846  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3124  insertion sequence transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000108202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1827  IS1541 transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3173  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.616713  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3488  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3506  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0382  IS1469, transposase  39.01 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2533  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2889  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0848  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2631  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000741775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0279  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000713801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3209  transposase IS200-family protein  40.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000115009  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  40.14 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>