More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1561 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  100 
 
 		 148 aa  309  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  99.32 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  99.32 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  99.32 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  99.32 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  99.32 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  99.32 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  99.32 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  70.14 
 
 		 144 aa  222  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  70.55 
 
 		 145 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  70.55 
 
 		 145 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  69.39 
 
 		 145 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  69.39 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  69.57 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  69.57 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  69.57 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  69.57 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  69.57 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  69.57 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  69.57 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  69.57 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  68.84 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  68.71 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  68.71 
 
 		 145 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  70.45 
 
 		 145 aa  206  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  70.45 
 
 		 145 aa  206  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  70.45 
 
 		 145 aa  206  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  70.45 
 
 		 145 aa  206  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  70.45 
 
 		 145 aa  206  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  69.7 
 
 		 145 aa  203  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  69.7 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  53.96 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  53.96 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  53.96 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  38.69 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  38.69 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  40.15 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1951  IS200 family transposase  63.86 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  35.43 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  41.41 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  36.92 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  36.92 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  38.64 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  39.39 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  35.71 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  37.9 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  39.34 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  39.39 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  36.55 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3832  transposase IS200-family protein  41.27 
 
 		 200 aa  103  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  36.96 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  35.94 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  33.8 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  33.8 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  33.8 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  33.8 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  32.31 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  32.31 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  36.05 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  33.1 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  36.8 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  34.88 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0382  IS1469, transposase  35.94 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  40.17 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  34.62 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  39.32 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  39.32 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  39.01 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1138  IS1541 transposase  32.17 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.130419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  32.17 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2889  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3905  IS1541, transposase  32.17 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000085189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1297  IS1541 transposase  32.17 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2234  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.893496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  32.17 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  32.17 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2995  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  32.17 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3173  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.616713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0407  IS1541 transposase  32.17 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000708618  hitchhiker  0.0000208321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2533  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  32.17 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>