More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3671 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  100 
 
 
148 aa  304  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  37.69 
 
 
133 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  39.55 
 
 
187 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  39.55 
 
 
133 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  39.55 
 
 
133 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  39.55 
 
 
187 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  41.13 
 
 
123 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  36.15 
 
 
136 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  40.15 
 
 
149 aa  103  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  40.15 
 
 
149 aa  103  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  41.13 
 
 
123 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  35.11 
 
 
143 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 
134 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  39.39 
 
 
149 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  39.39 
 
 
149 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  40.83 
 
 
121 aa  100  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  36.05 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  36.05 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  36.05 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  36.05 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  36.05 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  36.05 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  36.05 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  36.05 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  36.92 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  35.59 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  29.01 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  35.59 
 
 
129 aa  94  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  35.11 
 
 
139 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  35.11 
 
 
139 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  35.11 
 
 
139 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  31.03 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  38.66 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  34.62 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  34.75 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  35.21 
 
 
147 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  35.21 
 
 
147 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  34.59 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  34.75 
 
 
129 aa  92  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1732  hypothetical protein  37.82 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1731  hypothetical protein  37.82 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  31.5 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  43.75 
 
 
105 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  43.75 
 
 
105 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  29.69 
 
 
131 aa  90.9  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  29.69 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  33.9 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  29.69 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 
136 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  33.78 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  33.78 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  36 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  33.78 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  34.01 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  34.01 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  34.01 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  34.01 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  34.01 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  34.01 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  34.01 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  34.01 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  34.01 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  34.35 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  34.35 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  34.35 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  34.35 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  34.35 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  33.78 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  32.31 
 
 
138 aa  87  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  31.5 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  42.71 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  30.77 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  32.03 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  32.03 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1768  hypothetical protein  37.84 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.3207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  32.03 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  32.03 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  33.59 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  30.77 
 
 
160 aa  84.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  32.56 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  30.77 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  34.85 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  34.4 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  30 
 
 
155 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  30 
 
 
155 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  30 
 
 
155 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  30 
 
 
155 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1740  hypothetical protein  36.94 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.431395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1907  hypothetical protein  36.94 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  33.59 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1829  hypothetical protein  36.94 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.615719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  36.22 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  31.3 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  31.5 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  34.71 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>