More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1682 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  100 
 
 		 149 aa  312  8e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  82.64 
 
 		 151 aa  258  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  40.62 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  38.89 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  34.43 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  38.1 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  37.3 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  37.3 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  38.21 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  35.77 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  37.9 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  37.4 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  32.56 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  38.71 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  38.02 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  35.43 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  36.67 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  33.83 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  35.77 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  34.33 
 
 		 315 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  33.33 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  35.83 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  35 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  33.9 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  35 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  35.43 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  35.43 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  34.17 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  32.54 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  34.35 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  33.05 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  33.05 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  33.05 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  33.05 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  33.05 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  31.5 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  35.71 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  31.71 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  38.61 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  38.61 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  35.25 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  34.15 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  35.25 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  32.06 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  33.08 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  33.08 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  33.08 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  32.06 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  34.68 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  37.29 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  30.66 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  32.31 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  32.31 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  30.08 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  30.08 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  36.44 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  36.63 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  29.51 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  33.05 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  34.43 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  29.51 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  36.36 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  30.89 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  31.75 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  34.75 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2203  transposase IS200-family protein  33.08 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  26.02 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  26.02 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  26.02 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  26.02 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  26.02 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  26.02 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  26.02 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  30.33 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  27.78 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  26.02 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  28.69 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  28.69 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  28.69 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  28.69 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>