More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0876 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  46.51 
 
 
131 aa  133  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  46.51 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  48.03 
 
 
140 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  46.51 
 
 
131 aa  131  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  40 
 
 
149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  42.64 
 
 
129 aa  124  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  42.64 
 
 
129 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  41.86 
 
 
129 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  41.86 
 
 
129 aa  121  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  41.86 
 
 
129 aa  120  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  45.38 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  43.08 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  40.6 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  43.18 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  43.18 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  43.18 
 
 
149 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  40.8 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  42.42 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  43.22 
 
 
132 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  43.22 
 
 
132 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  40.5 
 
 
133 aa  110  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  40 
 
 
134 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  37.69 
 
 
148 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  40 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  43.8 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  41.67 
 
 
193 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  41.32 
 
 
132 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  40.98 
 
 
121 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  38.02 
 
 
134 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  39.34 
 
 
136 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  37.9 
 
 
142 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  34.43 
 
 
149 aa  103  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  38.35 
 
 
136 aa  103  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  36.07 
 
 
151 aa  102  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  38.17 
 
 
128 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  38.17 
 
 
129 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  38.17 
 
 
129 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  41.32 
 
 
136 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  37.5 
 
 
171 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  36.72 
 
 
148 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  36.72 
 
 
148 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  36.72 
 
 
148 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  36.72 
 
 
148 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  36.72 
 
 
148 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  36.72 
 
 
148 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  36.72 
 
 
148 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  37.5 
 
 
140 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  36.51 
 
 
145 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  36.51 
 
 
145 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  36.51 
 
 
145 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  36.51 
 
 
145 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  36.51 
 
 
145 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  40 
 
 
139 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  40 
 
 
139 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  40 
 
 
139 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  38.28 
 
 
132 aa  99.4  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  38.28 
 
 
132 aa  99.4  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  35.94 
 
 
148 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  35.71 
 
 
145 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  35.71 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  46.28 
 
 
133 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 
156 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  37.12 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 
145 aa  97.1  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 
136 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  35.83 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1214  transposase IS200-family protein  36.67 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 
154 aa  95.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 
154 aa  95.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 
154 aa  95.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 
154 aa  95.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 
154 aa  95.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 
154 aa  95.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  36.07 
 
 
123 aa  94.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  36.07 
 
 
187 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  36.07 
 
 
123 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  35.54 
 
 
132 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  36.07 
 
 
187 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  36.07 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  36.07 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  34.35 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  36.13 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  36.13 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  36.67 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3188  transposase IS200-family protein  36.97 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1832  transposase, IS605 OrfB family  41.88 
 
 
510 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4736  transposase IS200-family protein  53.85 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  33.59 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  33.86 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  33.86 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  33.86 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5851  transposase IS200-family protein  32.5 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.626877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>