More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2998 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  100 
 
 
142 aa  296  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  55.8 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  46.92 
 
 
138 aa  135  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  45.52 
 
 
141 aa  130  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  42.19 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  42.19 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  42.19 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  42.19 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  42.19 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  42.97 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  42.97 
 
 
145 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  42.97 
 
 
145 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  42.97 
 
 
145 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  41.41 
 
 
145 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  42.19 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  41.41 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  42.19 
 
 
145 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  42.19 
 
 
148 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  42.19 
 
 
148 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  42.19 
 
 
148 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  42.19 
 
 
148 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  42.19 
 
 
148 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  42.19 
 
 
148 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  42.19 
 
 
148 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  41.41 
 
 
148 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  40.62 
 
 
144 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  37.31 
 
 
156 aa  104  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  37.9 
 
 
133 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2723  transposase IS200-family protein  52.81 
 
 
94 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  43.1 
 
 
131 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  40.32 
 
 
140 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  40.48 
 
 
131 aa  100  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 
144 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  36.07 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  41.73 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  41.73 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  40.48 
 
 
131 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
139 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
139 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
139 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  36.72 
 
 
158 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  37.88 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  34.33 
 
 
156 aa  98.2  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  37.88 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  37.88 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  39.2 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  36.43 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  37.5 
 
 
160 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  35.94 
 
 
158 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  37.93 
 
 
129 aa  95.9  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  37.21 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  37.12 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  34.85 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  37.12 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  37.12 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  36.72 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  35.61 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  34.85 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  37.12 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  37.93 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  35.77 
 
 
315 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  29.01 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  40 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  40 
 
 
155 aa  94  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  40 
 
 
154 aa  94  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  37.07 
 
 
129 aa  93.6  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  34.85 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  37.07 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  40.83 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  37.69 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  37.07 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  38.71 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3832  transposase IS200-family protein  35.82 
 
 
200 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
154 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
154 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
154 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
154 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  39.17 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
154 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
151 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
154 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>