More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3079 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  100 
 
 		 138 aa  287  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  46.92 
 
 		 142 aa  135  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  44.27 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  37.9 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2723  transposase IS200-family protein  50.63 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  38.71 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  38.71 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  37.9 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  37.9 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  37.1 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  36.29 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  36.29 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  36.29 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  36.29 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  36.29 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  37.1 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  30.89 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  34.11 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  35.66 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  35.48 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  35.48 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  34.68 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  36.84 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  31.25 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  36.84 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  36.8 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  36.8 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  36.8 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  36.8 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  36.8 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  36.8 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  36.8 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  31.25 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  32.14 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  36.84 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  27.54 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  30.88 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  32.86 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  34.4 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  30.47 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  31.25 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  35.2 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  35.2 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  37.07 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  34.4 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  31.25 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  31.25 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  36.84 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  34.59 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  32.76 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  36 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  30.47 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  32.76 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  34.92 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  34.96 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  28.91 
 
 		 130 aa  84.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  36.79 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  27.91 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  28.68 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  27.61 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  34.96 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  34.78 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  34.78 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  34.78 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  35.2 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  35.2 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  33.85 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  35.71 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  33.85 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  30.47 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  35.48 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  35.71 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  32.81 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>