More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0074 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  100 
 
 		 151 aa  317  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  82.64 
 
 		 149 aa  258  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  39.84 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  34.88 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  38.89 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  36.07 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  37.98 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  38.89 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  38.1 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  38.1 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  36.09 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  37.4 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  38.58 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  37.4 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  38.58 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  37.29 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  36 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  36 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  34.92 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  36 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  38.21 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  36.44 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  36.44 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  36.44 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  36.44 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  36.44 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  34.27 
 
 		 315 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  33.57 
 
 		 175 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  34.17 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  37.4 
 
 		 129 aa  90.5  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  36 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  36 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  33.86 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  35.56 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  36.22 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  35.2 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  41.67 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  41.67 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  30.89 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  32.52 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  32.52 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  32.52 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  38.98 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  31.75 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  39.58 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  35.71 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  32.33 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  35 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  35.77 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  35.77 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  30.89 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  32.54 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  33.88 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  32.79 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  38.66 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2203  transposase IS200-family protein  34.31 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  35.66 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  35.66 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  35.66 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  37.82 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  37.27 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  29.79 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  32.2 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  27.07 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  27.07 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  27.07 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  27.07 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  27.07 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  27.07 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  27.07 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  27.07 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  30.08 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  30.08 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  27.07 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  32.23 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  32.2 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  26.83 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  26.83 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  26.83 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  26.72 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  26.72 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  26.72 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  26.72 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>