More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1391 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1391  transposase  100 
 
 
138 aa  288  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  97.83 
 
 
146 aa  282  9e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  75.91 
 
 
138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  62.77 
 
 
175 aa  186  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  63.5 
 
 
315 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  62.04 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  56.2 
 
 
142 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  56.2 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  54.74 
 
 
141 aa  160  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  52.9 
 
 
147 aa  153  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  52.86 
 
 
137 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  50.38 
 
 
142 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  60 
 
 
166 aa  146  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  48.87 
 
 
134 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  45.04 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  46.27 
 
 
137 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  45.52 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  45.52 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  46.21 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  46.27 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  46.27 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  43.48 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  45.52 
 
 
137 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  46.27 
 
 
137 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  44.03 
 
 
137 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  46.15 
 
 
140 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  42.64 
 
 
135 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  38.85 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  41.86 
 
 
137 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  38.93 
 
 
139 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  38.93 
 
 
139 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  38.93 
 
 
139 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  40.77 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  38.46 
 
 
136 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  41.88 
 
 
122 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  39.69 
 
 
136 aa  107  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
132 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  39.1 
 
 
139 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
132 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
132 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
132 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
132 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  40.65 
 
 
134 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  40.65 
 
 
134 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 
130 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
134 aa  102  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0416  transposase IS200-family protein  39.84 
 
 
134 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.179707  normal  0.0295664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0456  transposase IS200-family protein  39.84 
 
 
134 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3555  transposase IS200-family protein  39.84 
 
 
134 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3851  transposase IS200-family protein  39.84 
 
 
134 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0764343  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2203  transposase IS200-family protein  32.82 
 
 
140 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  34.13 
 
 
133 aa  101  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1192  transposase IS200-family protein  39.84 
 
 
134 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.541746  normal  0.0271846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  39.84 
 
 
134 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  34.62 
 
 
131 aa  100  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  40.31 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  40.31 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  34.62 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  34.62 
 
 
131 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  38.58 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  35.61 
 
 
187 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  36.36 
 
 
187 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  38.21 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  36.36 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  36.36 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  33.08 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  34.85 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  37.98 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  35.94 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  35.94 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  38.46 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  37.69 
 
 
132 aa  94.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  34.88 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0519  transposase IS200  37.5 
 
 
116 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  35.77 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  35.77 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  32.03 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  36.43 
 
 
136 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  35.66 
 
 
130 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  32.82 
 
 
134 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  35.43 
 
 
149 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  35.94 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  37.4 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  35.94 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  35.94 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
137 aa  87  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  36.3 
 
 
149 aa  86.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  36.3 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  36.3 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  35.2 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0226  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.262027  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  32.56 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  32.03 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  35.38 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  35.38 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  35.38 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  35.38 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  35.38 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1624  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>