More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2962 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  100 
 
 		 171 aa  354  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  100 
 
 		 140 aa  290  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  81.62 
 
 		 193 aa  240  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  72.79 
 
 		 140 aa  208  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1214  transposase IS200-family protein  71.76 
 
 		 135 aa  200  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5851  transposase IS200-family protein  69.23 
 
 		 134 aa  193  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.626877 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  54.17 
 
 		 133 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  53.78 
 
 		 133 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5919  transposase IS200-family protein  59.26 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  56.67 
 
 		 132 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  57.63 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  57.63 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  56.67 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3849  transposase IS200-family protein  58.41 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  53.08 
 
 		 136 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  51.67 
 
 		 136 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  47.73 
 
 		 132 aa  131  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  47.73 
 
 		 132 aa  131  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  49.61 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  49.14 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  49.14 
 
 		 131 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  48.28 
 
 		 131 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  46.22 
 
 		 133 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  43.38 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  50.43 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  51.3 
 
 		 134 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  47.06 
 
 		 136 aa  122  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  49.57 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  46.09 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  43.75 
 
 		 128 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  44.96 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  48.7 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  48.7 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  48.7 
 
 		 129 aa  119  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  47.41 
 
 		 121 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  48.28 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  48.28 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  45.38 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  43.59 
 
 		 137 aa  112  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3188  transposase IS200-family protein  47.46 
 
 		 132 aa  110  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  42.28 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  46.36 
 
 		 135 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  46.36 
 
 		 135 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1764  transposase IS200-family protein  46.61 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0156  transposase IS200-family protein  46.61 
 
 		 132 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207506  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1754  transposase IS200-family protein  47.46 
 
 		 132 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.24327 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3154  transposase IS200-family protein  47.46 
 
 		 132 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2182  transposase IS200-family protein  46.61 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.872026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0738  transposase IS200-family protein  46.61 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  42.19 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  42.86 
 
 		 143 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  43.44 
 
 		 129 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  43.44 
 
 		 129 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 		 133 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  44.17 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0844  transposase IS200-family protein  47.06 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  39.37 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4667  transposase  48.91 
 
 		 92 aa  99  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  42.5 
 
 		 127 aa  95.9  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  39.82 
 
 		 117 aa  94.4  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  33.33 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  37.01 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  37.01 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  37.01 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 		 126 aa  92  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 		 126 aa  92  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 		 126 aa  92  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  34.07 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1198  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 104 aa  89  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  hitchhiker  0.00571107 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  36.97 
 
 		 123 aa  87.4  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  36.13 
 
 		 123 aa  85.5  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  33.9 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  33.07 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  31.5 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  38.98 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  38.98 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  38.98 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  38.98 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  38.98 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  38.98 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  32.09 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  35.71 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  33.07 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  33.07 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  37.98 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  38.98 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2871  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  31.34 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  31.34 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  38.14 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  32.28 
 
 		 137 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  32.28 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  34.43 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  35.83 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  32.03 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  34.13 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  38.14 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  38.14 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>