More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2871 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2871  transposase IS200-family protein  100 
 
 
143 aa  298  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  81.12 
 
 
126 aa  233  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  81.12 
 
 
126 aa  233  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  81.12 
 
 
126 aa  233  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  44.37 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  44.37 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  43.06 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  38.3 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  38.3 
 
 
131 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  37.59 
 
 
131 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  36.17 
 
 
140 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  38.51 
 
 
133 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  38.57 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  37.86 
 
 
129 aa  97.1  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  36.88 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  37.86 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  37.14 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  37.14 
 
 
129 aa  93.6  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  37.32 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  34.23 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  33.83 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  33.1 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  33.58 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  33.33 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  33.58 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  34.81 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  34.88 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  33.83 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  34.88 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  34.81 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  35.21 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  31.47 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  34.51 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  30.82 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  32.87 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  30.82 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  32.88 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  32.19 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  31.82 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  30.2 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  28.47 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  32.87 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  30.56 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  30.56 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  31.03 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  27.69 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0382  IS1469, transposase  32.21 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  30.14 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  30.14 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  30.6 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  29.17 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  32.19 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  30.41 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  32.19 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  30.14 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  32.86 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  30.14 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  30.14 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  30.14 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  30.14 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  30.14 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  30.14 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  30.07 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  28.48 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  28.48 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  28.48 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  28.48 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  30.07 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  30.77 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  29.93 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  27.66 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  27.66 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  28.77 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  29.45 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  27.66 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  27.66 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  27.66 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  33.57 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  29.37 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  27.66 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  29.17 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  30.63 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  27.59 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  27.66 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5851  transposase IS200-family protein  28.68 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.626877 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  29.73 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  29.37 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  29.37 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>