More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7258 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  100 
 
 
140 aa  286  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  72.79 
 
 
171 aa  208  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  72.79 
 
 
140 aa  207  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  76.12 
 
 
193 aa  204  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1214  transposase IS200-family protein  74.63 
 
 
135 aa  204  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5851  transposase IS200-family protein  68.66 
 
 
134 aa  183  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.626877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5919  transposase IS200-family protein  69.29 
 
 
131 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3849  transposase IS200-family protein  62.18 
 
 
152 aa  143  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416532  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  47.62 
 
 
133 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  50.42 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  50.85 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  48.82 
 
 
133 aa  123  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  50.43 
 
 
138 aa  120  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  50.43 
 
 
138 aa  120  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  48.44 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  44.92 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  47.54 
 
 
132 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  47.54 
 
 
132 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  44.35 
 
 
140 aa  114  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  45.45 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  42.24 
 
 
131 aa  110  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  44.92 
 
 
136 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  44 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  41.09 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  41.38 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  42.4 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  43.41 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  42.24 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  43.9 
 
 
128 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  43.1 
 
 
133 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  43.48 
 
 
129 aa  104  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  44.44 
 
 
130 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  40.52 
 
 
132 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  40.52 
 
 
132 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  41.03 
 
 
137 aa  102  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  43.1 
 
 
121 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  42.61 
 
 
129 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  41.74 
 
 
129 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  41.74 
 
 
129 aa  100  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  41.74 
 
 
129 aa  100  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  40.8 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3188  transposase IS200-family protein  40.68 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  42.73 
 
 
135 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  42.73 
 
 
135 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0738  transposase IS200-family protein  41.53 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2182  transposase IS200-family protein  40.68 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.872026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  36.67 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0156  transposase IS200-family protein  39.83 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207506  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3154  transposase IS200-family protein  40.87 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1764  transposase IS200-family protein  40 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1754  transposase IS200-family protein  40.87 
 
 
132 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.24327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  37.3 
 
 
134 aa  90.1  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  36.89 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  36.89 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0844  transposase IS200-family protein  38.26 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  34.68 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  37.82 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4667  transposase  42.7 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  35.04 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  35.04 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  35.04 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  32.54 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3503  hypothetical protein  56.25 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  29.77 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  32.85 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  31.45 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  31.45 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
137 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1198  transposase IS200-family protein  42.55 
 
 
104 aa  77  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  hitchhiker  0.00571107 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  31.82 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  38.26 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  31.15 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  32 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  37.19 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  32.54 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  31.4 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  34.88 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  35.65 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  38.02 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  38.02 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  38.02 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  38.02 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  37.19 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  30.33 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  36.52 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  34.71 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  36.52 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  36.52 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  36.52 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  36.52 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  36.52 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>