45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3503 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3503  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1214  transposase IS200-family protein  68.35 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5851  transposase IS200-family protein  71.01 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.626877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  56.79 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3849  transposase IS200-family protein  77.01 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  59.42 
 
 		 171 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  53.85 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  58.57 
 
 		 193 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  46.38 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  43.28 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  44.83 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  48.21 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  41.38 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  36.11 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  36.11 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  39.68 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5919  transposase IS200-family protein  42.17 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  40.74 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  34.72 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  43.4 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  43.4 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  34.78 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  40.74 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  34.55 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  34.55 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  30.56 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  34.55 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  47.83 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0833  IS1004 transposase  38.46 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0275902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  32.73 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  41.38 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  42.31 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  42.31 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  41.38 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  41.38 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  32.31 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  32.31 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2830  transposase IS200-family protein  36.21 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  40.74 
 
 		 130 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3188  transposase IS200-family protein  37.04 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  26.87 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2182  transposase IS200-family protein  42 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.872026 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  36.21 
 
 		 132 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  37.04 
 
 		 128 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>