209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5919 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5919  transposase IS200-family protein  100 
 
 		 131 aa  263  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  69.29 
 
 		 140 aa  177  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  62.22 
 
 		 193 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  59.26 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  59.26 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1214  transposase IS200-family protein  60 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5851  transposase IS200-family protein  58.21 
 
 		 134 aa  137  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.626877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  40 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  40.17 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  43.59 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  41.88 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  42.11 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  41.53 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  41.53 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  36.44 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  38.98 
 
 		 136 aa  91.3  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3849  transposase IS200-family protein  47.9 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  38.46 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  36.29 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  37.21 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  37.1 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  35.65 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  38.26 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  38.26 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  37.39 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  35.34 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  35.34 
 
 		 131 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  36.52 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  36.52 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  37.61 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  37.61 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  34.48 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  38.26 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  35 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  35.65 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  30.91 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0738  transposase IS200-family protein  33.9 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1754  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.24327 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2182  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.872026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  29.84 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0156  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207506  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1764  transposase IS200-family protein  33.04 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3188  transposase IS200-family protein  33.93 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  31.93 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  31.86 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  31.86 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3154  transposase IS200-family protein  31.3 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0844  transposase IS200-family protein  31.3 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  31.53 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  31.53 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1198  transposase IS200-family protein  39.51 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  hitchhiker  0.00571107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  30.09 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  29.84 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  29.84 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  27.5 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  29.84 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  29.84 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  27.34 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  28.93 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  28 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  28.8 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  28.8 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  28.8 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  28.33 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  30.89 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  30.4 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  28.93 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4667  transposase  34.62 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  31.4 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  31.4 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  31.2 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  28.35 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  28.35 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  27.5 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  28.1 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  34.23 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  34.65 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  25.98 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  23.62 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  27.69 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  23.62 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  28.23 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  32.43 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  32.43 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  32.43 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  32.43 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  32.43 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  32.26 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  32.26 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0456  transposase IS200-family protein  23.62 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3555  transposase IS200-family protein  23.62 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0416  transposase IS200-family protein  23.62 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.179707  normal  0.0295664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>