More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0471 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  100 
 
 
123 aa  256  9e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  97.56 
 
 
187 aa  252  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  98.37 
 
 
123 aa  251  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  96.75 
 
 
187 aa  248  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  95.93 
 
 
133 aa  245  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  95.93 
 
 
133 aa  245  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  97.14 
 
 
105 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  97.14 
 
 
105 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  96.19 
 
 
105 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  66.67 
 
 
134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  59.84 
 
 
136 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0127  ISCpe2, transposase orfA  96.55 
 
 
66 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  46.28 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  46.28 
 
 
136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
148 aa  104  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1030  ISCpe2, transposase orfA  97.96 
 
 
55 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.28283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  42.98 
 
 
132 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  40.52 
 
 
132 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  40.52 
 
 
132 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  42.24 
 
 
136 aa  100  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  43.1 
 
 
128 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  37.4 
 
 
149 aa  99  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  36.07 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  45.22 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  37.4 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  36.44 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  36.44 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  39.02 
 
 
133 aa  97.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  36.07 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  36.07 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  41.67 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  40.98 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  38.79 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  35.25 
 
 
149 aa  94.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  39.02 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  34.75 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  36.07 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1731  hypothetical protein  37.93 
 
 
135 aa  94  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1732  hypothetical protein  37.93 
 
 
135 aa  94  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1768  hypothetical protein  38.6 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.3207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  39.67 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0710  ISCpe2, transposase orfA  97.67 
 
 
43 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  35.77 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1740  hypothetical protein  37.72 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.431395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1829  hypothetical protein  37.72 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.615719 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1907  hypothetical protein  37.72 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  35.77 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  37.07 
 
 
128 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0888  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 
43 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.306894  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  39.34 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  41.18 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  41.18 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  41.18 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  41.18 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  41.18 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  38.33 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
129 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  41.46 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  34.4 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  40.34 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  32.5 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  36.21 
 
 
130 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  87  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  38.66 
 
 
134 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  37.19 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  36.67 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  36.67 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  36.97 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  32.5 
 
 
193 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  36.13 
 
 
171 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  36.13 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  31.71 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  40.34 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  37.29 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  32.52 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  33.33 
 
 
315 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  32.52 
 
 
175 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  35 
 
 
142 aa  84  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  35.25 
 
 
148 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  35.25 
 
 
148 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  35.25 
 
 
148 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  35.25 
 
 
148 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  35.25 
 
 
148 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  35.25 
 
 
148 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  35.25 
 
 
148 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0866  hypothetical protein  37 
 
 
128 aa  84  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  35.25 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  35.54 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  35.9 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  35.9 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>