32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0710 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  97.67 
 
 		 123 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0710  ISCpe2, transposase orfA  100 
 
 		 43 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1030  ISCpe2, transposase orfA  97.67 
 
 		 55 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.28283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 		 187 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 		 187 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0888  ISCpe2, transposase orfA  97.67 
 
 		 43 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.306894  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  93.02 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0127  ISCpe2, transposase orfA  93.02 
 
 		 66 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  73.81 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  75 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  54.76 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  43.9 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  51.35 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  43.59 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  43.59 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  41.03 
 
 		 138 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  41.67 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  42.5 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  42.5 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  42.5 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  39.02 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  47.62 
 
 		 145 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  47.62 
 
 		 145 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  47.62 
 
 		 145 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  47.62 
 
 		 145 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  47.62 
 
 		 145 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  47.62 
 
 		 145 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>