60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0127 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0127  ISCpe2, transposase orfA  100 
 
 		 66 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  98.28 
 
 		 187 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  96.55 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  96.55 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  96.55 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  94.83 
 
 		 105 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  94.83 
 
 		 105 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  94.83 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  94.83 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  91.38 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1030  ISCpe2, transposase orfA  93.88 
 
 		 55 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.28283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  71.93 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0710  ISCpe2, transposase orfA  93.02 
 
 		 43 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0888  ISCpe2, transposase orfA  90.7 
 
 		 43 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.306894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  68.97 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  43.33 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  40.98 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  44.64 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  37.7 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  35.09 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  35.09 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  35.09 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  39.66 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  39.66 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  37.93 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  35.09 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  35.59 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  38.98 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  39.66 
 
 		 315 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  43.4 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  35.59 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  35.59 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  35.59 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  35.59 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  42.37 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  42.37 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  42.37 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  42.37 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  42.37 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  29.31 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  42.37 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  31.58 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  31.58 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  29.82 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  35.71 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 		 145 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  32.2 
 
 		 133 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 		 145 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  41.07 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1951  IS200 family transposase  39.29 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  41.07 
 
 		 129 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  41.07 
 
 		 129 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>