18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0888 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  97.67 
 
 		 187 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  97.67 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0888  ISCpe2, transposase orfA  100 
 
 		 43 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.306894  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0710  ISCpe2, transposase orfA  97.67 
 
 		 43 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1030  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 		 55 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.28283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  93.02 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  93.02 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  93.02 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  93.02 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  93.02 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0127  ISCpe2, transposase orfA  90.7 
 
 		 66 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  90.7 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  71.43 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  72.5 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  52.38 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  41.46 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  39.02 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>