More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1566 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  99.19 
 
 
187 aa  257  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  100 
 
 
123 aa  256  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  98.37 
 
 
123 aa  251  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  96.75 
 
 
187 aa  248  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  95.93 
 
 
133 aa  245  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  95.93 
 
 
133 aa  245  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  96.19 
 
 
105 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  96.19 
 
 
105 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  95.24 
 
 
105 aa  206  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  66.67 
 
 
134 aa  179  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  59.84 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  47.11 
 
 
136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0127  ISCpe2, transposase orfA  94.83 
 
 
66 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  47.11 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  43.8 
 
 
132 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  41.13 
 
 
148 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  43.1 
 
 
136 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 
128 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  41.38 
 
 
132 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  41.38 
 
 
132 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  38.21 
 
 
149 aa  101  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1030  ISCpe2, transposase orfA  95.92 
 
 
55 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.28283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  39.84 
 
 
133 aa  100  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  41.8 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  45.22 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  36.07 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  39.84 
 
 
133 aa  97.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  37.4 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  36.07 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  36.07 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  36.44 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  36.44 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  41.67 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  38.79 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  35.25 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  34.75 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  36.07 
 
 
133 aa  93.6  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  37.93 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  38.33 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1731  hypothetical protein  37.93 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  34.17 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1732  hypothetical protein  37.93 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  39.67 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  40.16 
 
 
137 aa  92  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  34.17 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  34.17 
 
 
131 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  39.17 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  38.33 
 
 
129 aa  92  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0888  ISCpe2, transposase orfA  97.67 
 
 
43 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.306894  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  35.77 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  42.28 
 
 
133 aa  90.5  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  35.77 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1768  hypothetical protein  37.72 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.3207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  39.5 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0710  ISCpe2, transposase orfA  95.35 
 
 
43 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  37.07 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  38.02 
 
 
134 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  41.18 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  41.18 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  41.18 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  41.18 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  41.18 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  37.82 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  34.15 
 
 
315 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  33.33 
 
 
193 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  36.97 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1740  hypothetical protein  36.84 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.431395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1907  hypothetical protein  36.84 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1829  hypothetical protein  36.84 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.615719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  33.33 
 
 
175 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  34.4 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  38.14 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  36.97 
 
 
171 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  40.34 
 
 
145 aa  87  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  38.21 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  33.33 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  39.66 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  36.36 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  31.71 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  40.34 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  36.75 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 
134 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  36.75 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  36.75 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  36.75 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  36.75 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  36.75 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  36.75 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  32.5 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  36.13 
 
 
160 aa  84.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  35.9 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>