More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6350 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  100 
 
 
128 aa  266  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  84.38 
 
 
130 aa  228  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  78.91 
 
 
132 aa  220  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  78.91 
 
 
132 aa  220  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  76.56 
 
 
128 aa  219  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  72.66 
 
 
136 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  62.4 
 
 
136 aa  186  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  62.7 
 
 
136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  59.06 
 
 
132 aa  169  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  57.03 
 
 
132 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  57.52 
 
 
117 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  42.06 
 
 
133 aa  131  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  49.6 
 
 
136 aa  130  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  52.17 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  43.31 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  47.62 
 
 
134 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  48.84 
 
 
193 aa  124  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  46.09 
 
 
171 aa  120  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  46.09 
 
 
140 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  46.4 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  47.41 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  43.9 
 
 
135 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  43.9 
 
 
135 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3154  transposase IS200-family protein  43.65 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  43.9 
 
 
140 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  42.62 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  43.36 
 
 
132 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  43.36 
 
 
132 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  42.61 
 
 
140 aa  106  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  35.2 
 
 
137 aa  105  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3188  transposase IS200-family protein  40.48 
 
 
132 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  41.03 
 
 
131 aa  104  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  39.84 
 
 
133 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0738  transposase IS200-family protein  45.22 
 
 
129 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  41.38 
 
 
131 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 
138 aa  103  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  43.97 
 
 
138 aa  103  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1754  transposase IS200-family protein  43.48 
 
 
132 aa  103  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.24327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 
133 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0156  transposase IS200-family protein  40.48 
 
 
132 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207506  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  38.17 
 
 
133 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  39.17 
 
 
131 aa  100  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5851  transposase IS200-family protein  40 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.626877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1214  transposase IS200-family protein  41.8 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1764  transposase IS200-family protein  41.74 
 
 
132 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2182  transposase IS200-family protein  41.74 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.872026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  38.46 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0844  transposase IS200-family protein  40.87 
 
 
132 aa  94  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  37.3 
 
 
145 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  37.3 
 
 
145 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  38.46 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  38.6 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  37.93 
 
 
187 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  37.93 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  37.93 
 
 
187 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  36.52 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  35.29 
 
 
129 aa  92  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  37.5 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  33.07 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  37.07 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  37.07 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  34.88 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  34.88 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  34.88 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  34.88 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  34.88 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  35.65 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  37.98 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  35.65 
 
 
129 aa  90.9  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  34.13 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  37.8 
 
 
130 aa  90.5  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  37.07 
 
 
123 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  34.45 
 
 
129 aa  90.1  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  38.66 
 
 
136 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  38.46 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  32.28 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  37.07 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  37.6 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  37.93 
 
 
139 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  34.65 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  35.71 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  38.18 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  34.65 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  41.03 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  31.5 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  34.65 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  34.11 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  29.41 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>