More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0393 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  100 
 
 
122 aa  254  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  75.21 
 
 
140 aa  188  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  53.15 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  42.74 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  42.74 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  42.74 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  41.88 
 
 
137 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  41.88 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  41.88 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  41.88 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  43.48 
 
 
137 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  42.11 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 
139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 
139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  40.35 
 
 
139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  43.86 
 
 
142 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  44.35 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  43.48 
 
 
147 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  41.88 
 
 
138 aa  107  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  36.75 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  41.88 
 
 
146 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  36.75 
 
 
315 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  42.11 
 
 
137 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  40.17 
 
 
138 aa  104  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0519  transposase IS200  46.43 
 
 
116 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  42.48 
 
 
141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  42.86 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  38.98 
 
 
140 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  35.65 
 
 
141 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  33.62 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  39.29 
 
 
134 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  39.29 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  34.78 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  39.29 
 
 
134 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  38.18 
 
 
128 aa  88.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0456  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3851  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0764343  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0416  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.179707  normal  0.0295664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3555  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 
136 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  40.21 
 
 
166 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1192  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
134 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.541746  normal  0.0271846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
135 aa  86.7  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  39.29 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  39.09 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
132 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
132 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  35.71 
 
 
134 aa  84  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
132 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
132 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
132 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  36.61 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  35.71 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  38.94 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  36.36 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  36.36 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0226  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.262027  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  37.27 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  38.18 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  34.23 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1624  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  36.61 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1061  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187009  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  34.86 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  34.55 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  32.74 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  36.94 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  35.45 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  34.58 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  32.41 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  32.41 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  30.91 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  32.41 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  30.43 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  34.55 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  34.26 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  31.82 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  31.82 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  32.73 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3188  transposase IS200-family protein  30 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  33.64 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  35.45 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  30.58 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  30.58 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  33.93 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  33.33 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  33.33 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  33.33 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  33.33 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  33.93 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  30.91 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  33.33 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  33.33 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>