More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0640 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  98.58 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  66.67 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  63.64 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  54.74 
 
 		 138 aa  160  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  54.74 
 
 		 146 aa  158  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  57.25 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  52.55 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  49.28 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  49.28 
 
 		 315 aa  140  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  50.76 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  45.38 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  43.26 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  41.79 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  41.79 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  41.79 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  40.88 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  41.61 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  41.04 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  41.04 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  41.04 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  47.9 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  41.04 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  39.55 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  40.98 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 		 134 aa  103  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  35.38 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  33.33 
 
 		 140 aa  95.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  39.39 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  29.77 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0519  transposase IS200  39.82 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  37.96 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2203  transposase IS200-family protein  32.59 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  36.8 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  36.8 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  32 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  34.78 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  34.4 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  32.82 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  34.65 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  30.89 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  39.52 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  39.52 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  39.52 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  30.89 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  31.71 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1192  transposase IS200-family protein  30.08 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.541746  normal  0.0271846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3555  transposase IS200-family protein  30.08 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3851  transposase IS200-family protein  30.08 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0764343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0456  transposase IS200-family protein  30.08 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0416  transposase IS200-family protein  30.08 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.179707  normal  0.0295664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  31.78 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  31.2 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  31.2 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  31.2 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  31.2 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  31.2 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  34.59 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  37.07 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  35.61 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  35.61 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  31.75 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  28.91 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  28.91 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  29.01 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  31.3 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  28.91 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  28.91 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  34.59 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  31.75 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  34.59 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  31.75 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  28.68 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  30.23 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  33.08 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  30.16 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0226  transposase IS200-family protein  31.86 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.262027  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  34.88 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  34.88 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1624  transposase IS200-family protein  31.86 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  34.45 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  36.21 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  34.48 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1061  transposase IS200-family protein  31.86 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187009  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  30.3 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  28.79 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  28.57 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2322  transposase IS200-family protein  29.41 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  30.3 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  35.34 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  29.55 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  27.48 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  30.23 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>