134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3849 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3849  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  303  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416532  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5851  transposase IS200-family protein  71.64 
 
 
134 aa  185  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.626877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1214  transposase IS200-family protein  70.15 
 
 
135 aa  175  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  62.86 
 
 
140 aa  166  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  55.32 
 
 
171 aa  153  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  57.46 
 
 
140 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  55.15 
 
 
193 aa  140  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  44.26 
 
 
133 aa  100  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5919  transposase IS200-family protein  47.97 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  46.09 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  37.19 
 
 
133 aa  94  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1688  transposase IS200-family protein  45.08 
 
 
133 aa  90.5  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3503  hypothetical protein  78.16 
 
 
95 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  42.24 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  42.24 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  38.93 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  35.61 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  40.5 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  40.5 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  36.8 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  38.39 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  36.44 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  37.39 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  36.52 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  36.52 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  37.07 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  37.07 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  40.54 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  35.9 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  38.74 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  36.21 
 
 
131 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  35.43 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  35.9 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  33.04 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  33.04 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3188  transposase IS200-family protein  35.9 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  30.36 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  35.9 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  30.25 
 
 
133 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  31.78 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  31.78 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1764  transposase IS200-family protein  36.04 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2182  transposase IS200-family protein  36.94 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.872026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4667  transposase  38.04 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0738  transposase IS200-family protein  36.04 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  30.09 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0156  transposase IS200-family protein  35.14 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207506  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  32.77 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1754  transposase IS200-family protein  36.04 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.24327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  30.36 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0844  transposase IS200-family protein  35.14 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  27.56 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  28.7 
 
 
149 aa  60.5  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3154  transposase IS200-family protein  35.14 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  27.56 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1198  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  hitchhiker  0.00571107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  30.58 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  30.17 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  30.17 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  25.19 
 
 
187 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0519  transposase IS200  28.97 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  25.19 
 
 
187 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  26.85 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  21.54 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  25.98 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  25.98 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  29.91 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  23.33 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  28.87 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  24.37 
 
 
123 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  24.37 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  23.66 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  25.21 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  22.5 
 
 
135 aa  47.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  25.21 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  25.21 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  21.67 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  23.66 
 
 
137 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  21.67 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  21.67 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  21.67 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  23.66 
 
 
137 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  26.42 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  21.67 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  23.66 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  23.66 
 
 
137 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  24.19 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  25.86 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  22.9 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  23.66 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  18.6 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  26.36 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  26.36 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  26.36 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  18.6 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>