More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2234 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3359  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.766936 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2613  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1138  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.130419  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1993  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3905  IS1541, transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000085189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0029  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2576  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2539  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1827  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0407  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000708618  hitchhiker  0.0000208321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0793  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365288  normal  0.44998 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2455  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2283  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1297  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0116  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2930  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2812  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.67972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3020  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3031  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000139818  normal  0.117471 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3065  IS1541 transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3124  insertion sequence transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000108202  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  100 
 
 
169 aa  320  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2234  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  320  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.893496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0279  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  320  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000713801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3209  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  320  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000115009  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3173  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  320  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.616713  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0848  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  320  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2631  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  320  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000741775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2889  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  320  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1679  transposase IS200-family protein  99.34 
 
 
152 aa  319  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3506  transposase IS200-family protein  99.34 
 
 
152 aa  319  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3488  transposase IS200-family protein  99.34 
 
 
152 aa  319  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2995  transposase IS200-family protein  99.34 
 
 
152 aa  319  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2533  transposase IS200-family protein  99.34 
 
 
152 aa  319  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0846  transposase IS200-family protein  99.34 
 
 
152 aa  319  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0617  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  317  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000906641  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1972  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  317  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2227  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  317  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835855  hitchhiker  0.00464434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1554  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  317  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0333  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  317  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000846816  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0104  IS605 family transposase  99.34 
 
 
152 aa  317  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.78108e-62  hitchhiker  1.21506e-131 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0057  IS605 family transposase  99.34 
 
 
152 aa  317  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.12196e-96  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0809  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1357  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0501528  decreased coverage  0.000176837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3353  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0668  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00213867  normal  0.30365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1020  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0847  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.870119  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3496  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123601  normal  0.0116107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2618  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.361666  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3869  IS1541, transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000363831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3198  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225363  hitchhiker  0.00159351 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0340  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119674  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4092  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0285  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2661  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000522889  hitchhiker  0.00627277 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0253  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000556152  hitchhiker  0.00000156199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2559  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000200847  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1992  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2202  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.78238 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1620  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.61818 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1610  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122723  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1836  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3626  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0103  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3380  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.126492  normal  0.442145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2303  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.906471  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2332  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000426065  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3616  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3888  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.394017 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1602  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1609  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0741274  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1279  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000981056  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3489  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00349338  normal  0.0960854 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2949  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.467669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2751  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000125524  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3050  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129671  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3134  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3159  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.963476  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2584  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000573294  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2598  IS1541 transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1768  IS1541, transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000130923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1967  IS1541, transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2877  IS1541, transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3127  IS1541, transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.53689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3398  IS1541, transposase  99.34 
 
 
169 aa  316  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>